Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0M8

BC051142, Testis specific basic protein, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC051142Q3V0M8 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BC051142Q3V0M8 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BC051142Q3V0M8 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BC051142Q3V0M8 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BC051142Q3V0M8 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BC051142Q3V0M8 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BC051142Q3V0M8 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BC051142Q3V0M8 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BC051142Q3V0M8 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BC051142Q3V0M8 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BC051142Q3V0M8 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BC051142Q3V0M8 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BC051142Q3V0M8 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BC051142Q3V0M8 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BC051142Q3V0M8 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.15
BC051142Q3V0M8 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BC051142Q3V0M8 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BC051142Q3V0M8 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BC051142Q3V0M8 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
BC051142Q3V0M8 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BC051142Q3V0M8 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BC051142Q3V0M8 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BC051142Q3V0M8 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BC051142Q3V0M8 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BC051142Q3V0M8 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BC051142Q3V0M8 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
BC051142Q3V0M8 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BC051142Q3V0M8 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BC051142Q3V0M8 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BC051142Q3V0M8 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BC051142Q3V0M8 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BC051142Q3V0M8 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BC051142Q3V0M8 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BC051142Q3V0M8 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BC051142Q3V0M8 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BC051142Q3V0M8 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BC051142Q3V0M8 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BC051142Q3V0M8 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BC051142Q3V0M8 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BC051142Q3V0M8 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BC051142Q3V0M8 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BC051142Q3V0M8 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BC051142Q3V0M8 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BC051142Q3V0M8 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BC051142Q3V0M8 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BC051142Q3V0M8 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
BC051142Q3V0M8 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BC051142Q3V0M8 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BC051142Q3V0M8 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BC051142Q3V0M8 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BC051142Q3V0M8 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BC051142Q3V0M8 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
BC051142Q3V0M8 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
BC051142Q3V0M8 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BC051142Q3V0M8 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BC051142Q3V0M8 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BC051142Q3V0M8 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BC051142Q3V0M8 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BC051142Q3V0M8 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
BC051142Q3V0M8 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BC051142Q3V0M8 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BC051142Q3V0M8 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BC051142Q3V0M8 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BC051142Q3V0M8 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BC051142Q3V0M8 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BC051142Q3V0M8 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BC051142Q3V0M8 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BC051142Q3V0M8 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BC051142Q3V0M8 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BC051142Q3V0M8 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BC051142Q3V0M8 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BC051142Q3V0M8 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BC051142Q3V0M8 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BC051142Q3V0M8 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BC051142Q3V0M8 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BC051142Q3V0M8 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BC051142Q3V0M8 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BC051142Q3V0M8 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BC051142Q3V0M8 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BC051142Q3V0M8 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BC051142Q3V0M8 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BC051142Q3V0M8 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BC051142Q3V0M8 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BC051142Q3V0M8 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BC051142Q3V0M8 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BC051142Q3V0M8 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BC051142Q3V0M8 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BC051142Q3V0M8 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BC051142Q3V0M8 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BC051142Q3V0M8 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BC051142Q3V0M8 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BC051142Q3V0M8 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BC051142Q3V0M8 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BC051142Q3V0M8 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BC051142Q3V0M8 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BC051142Q3V0M8 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BC051142Q3V0M8 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BC051142Q3V0M8 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BC051142Q3V0M8 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BC051142Q3V0M8 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms