Protein–RNA interactions for Protein: Q3UTQ7

Prdm10, PR domain zinc finger protein 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm10Q3UTQ7 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Prdm10Q3UTQ7 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Prdm10Q3UTQ7 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Prdm10Q3UTQ7 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Prdm10Q3UTQ7 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Prdm10Q3UTQ7 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Prdm10Q3UTQ7 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Prdm10Q3UTQ7 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Prdm10Q3UTQ7 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Prdm10Q3UTQ7 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Prdm10Q3UTQ7 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Prdm10Q3UTQ7 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Prdm10Q3UTQ7 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Prdm10Q3UTQ7 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Prdm10Q3UTQ7 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Prdm10Q3UTQ7 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Prdm10Q3UTQ7 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Prdm10Q3UTQ7 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Prdm10Q3UTQ7 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Prdm10Q3UTQ7 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Prdm10Q3UTQ7 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Prdm10Q3UTQ7 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Prdm10Q3UTQ7 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Prdm10Q3UTQ7 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Prdm10Q3UTQ7 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Prdm10Q3UTQ7 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Prdm10Q3UTQ7 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Prdm10Q3UTQ7 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Prdm10Q3UTQ7 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Prdm10Q3UTQ7 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Prdm10Q3UTQ7 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Prdm10Q3UTQ7 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Prdm10Q3UTQ7 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Prdm10Q3UTQ7 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Prdm10Q3UTQ7 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Prdm10Q3UTQ7 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Prdm10Q3UTQ7 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Prdm10Q3UTQ7 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Prdm10Q3UTQ7 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Prdm10Q3UTQ7 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Prdm10Q3UTQ7 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Prdm10Q3UTQ7 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Prdm10Q3UTQ7 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Prdm10Q3UTQ7 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Prdm10Q3UTQ7 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Prdm10Q3UTQ7 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Prdm10Q3UTQ7 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Prdm10Q3UTQ7 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Prdm10Q3UTQ7 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Prdm10Q3UTQ7 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Prdm10Q3UTQ7 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Prdm10Q3UTQ7 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Prdm10Q3UTQ7 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Prdm10Q3UTQ7 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Prdm10Q3UTQ7 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Prdm10Q3UTQ7 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Prdm10Q3UTQ7 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Prdm10Q3UTQ7 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Prdm10Q3UTQ7 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Prdm10Q3UTQ7 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Prdm10Q3UTQ7 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Prdm10Q3UTQ7 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Prdm10Q3UTQ7 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Prdm10Q3UTQ7 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Prdm10Q3UTQ7 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Prdm10Q3UTQ7 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Prdm10Q3UTQ7 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Prdm10Q3UTQ7 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Prdm10Q3UTQ7 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Prdm10Q3UTQ7 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Prdm10Q3UTQ7 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Prdm10Q3UTQ7 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Prdm10Q3UTQ7 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Prdm10Q3UTQ7 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Prdm10Q3UTQ7 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Prdm10Q3UTQ7 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Prdm10Q3UTQ7 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Prdm10Q3UTQ7 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Prdm10Q3UTQ7 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Prdm10Q3UTQ7 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Prdm10Q3UTQ7 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Prdm10Q3UTQ7 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Prdm10Q3UTQ7 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Prdm10Q3UTQ7 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Prdm10Q3UTQ7 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Prdm10Q3UTQ7 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Prdm10Q3UTQ7 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Prdm10Q3UTQ7 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Prdm10Q3UTQ7 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Prdm10Q3UTQ7 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Prdm10Q3UTQ7 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Prdm10Q3UTQ7 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Prdm10Q3UTQ7 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Prdm10Q3UTQ7 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Prdm10Q3UTQ7 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Prdm10Q3UTQ7 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Prdm10Q3UTQ7 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Prdm10Q3UTQ7 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Prdm10Q3UTQ7 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Prdm10Q3UTQ7 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.3 ms