Protein–RNA interactions for Protein: Q3UT53

BB287469, Expressed sequence BB287469, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BB287469Q3UT53 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
BB287469Q3UT53 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BB287469Q3UT53 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
BB287469Q3UT53 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BB287469Q3UT53 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BB287469Q3UT53 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BB287469Q3UT53 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
BB287469Q3UT53 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BB287469Q3UT53 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BB287469Q3UT53 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BB287469Q3UT53 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BB287469Q3UT53 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
BB287469Q3UT53 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BB287469Q3UT53 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
BB287469Q3UT53 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BB287469Q3UT53 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
BB287469Q3UT53 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BB287469Q3UT53 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BB287469Q3UT53 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
BB287469Q3UT53 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BB287469Q3UT53 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BB287469Q3UT53 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BB287469Q3UT53 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BB287469Q3UT53 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
BB287469Q3UT53 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BB287469Q3UT53 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BB287469Q3UT53 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BB287469Q3UT53 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BB287469Q3UT53 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BB287469Q3UT53 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BB287469Q3UT53 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BB287469Q3UT53 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BB287469Q3UT53 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
BB287469Q3UT53 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BB287469Q3UT53 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BB287469Q3UT53 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BB287469Q3UT53 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BB287469Q3UT53 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BB287469Q3UT53 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BB287469Q3UT53 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BB287469Q3UT53 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BB287469Q3UT53 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BB287469Q3UT53 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BB287469Q3UT53 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BB287469Q3UT53 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BB287469Q3UT53 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
BB287469Q3UT53 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
BB287469Q3UT53 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
BB287469Q3UT53 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
BB287469Q3UT53 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
BB287469Q3UT53 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
BB287469Q3UT53 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
BB287469Q3UT53 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
BB287469Q3UT53 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
BB287469Q3UT53 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
BB287469Q3UT53 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
BB287469Q3UT53 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
BB287469Q3UT53 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
BB287469Q3UT53 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BB287469Q3UT53 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BB287469Q3UT53 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BB287469Q3UT53 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BB287469Q3UT53 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BB287469Q3UT53 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BB287469Q3UT53 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BB287469Q3UT53 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BB287469Q3UT53 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BB287469Q3UT53 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BB287469Q3UT53 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BB287469Q3UT53 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BB287469Q3UT53 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BB287469Q3UT53 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BB287469Q3UT53 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BB287469Q3UT53 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BB287469Q3UT53 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BB287469Q3UT53 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BB287469Q3UT53 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BB287469Q3UT53 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BB287469Q3UT53 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BB287469Q3UT53 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BB287469Q3UT53 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BB287469Q3UT53 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BB287469Q3UT53 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BB287469Q3UT53 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BB287469Q3UT53 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BB287469Q3UT53 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BB287469Q3UT53 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BB287469Q3UT53 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
BB287469Q3UT53 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BB287469Q3UT53 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BB287469Q3UT53 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BB287469Q3UT53 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BB287469Q3UT53 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BB287469Q3UT53 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
BB287469Q3UT53 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BB287469Q3UT53 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BB287469Q3UT53 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BB287469Q3UT53 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BB287469Q3UT53 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BB287469Q3UT53 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms