Protein–RNA interactions for Protein: Q3URY0

Rtl4, Retrotransposon Gag-like protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl4Q3URY0 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rtl4Q3URY0 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rtl4Q3URY0 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rtl4Q3URY0 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rtl4Q3URY0 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rtl4Q3URY0 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rtl4Q3URY0 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rtl4Q3URY0 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rtl4Q3URY0 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rtl4Q3URY0 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rtl4Q3URY0 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Rtl4Q3URY0 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rtl4Q3URY0 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rtl4Q3URY0 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rtl4Q3URY0 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rtl4Q3URY0 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rtl4Q3URY0 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rtl4Q3URY0 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rtl4Q3URY0 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rtl4Q3URY0 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rtl4Q3URY0 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rtl4Q3URY0 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rtl4Q3URY0 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rtl4Q3URY0 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rtl4Q3URY0 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rtl4Q3URY0 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rtl4Q3URY0 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rtl4Q3URY0 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rtl4Q3URY0 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rtl4Q3URY0 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rtl4Q3URY0 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rtl4Q3URY0 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rtl4Q3URY0 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rtl4Q3URY0 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rtl4Q3URY0 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rtl4Q3URY0 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rtl4Q3URY0 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rtl4Q3URY0 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rtl4Q3URY0 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rtl4Q3URY0 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rtl4Q3URY0 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rtl4Q3URY0 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rtl4Q3URY0 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rtl4Q3URY0 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rtl4Q3URY0 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rtl4Q3URY0 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rtl4Q3URY0 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rtl4Q3URY0 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rtl4Q3URY0 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rtl4Q3URY0 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rtl4Q3URY0 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rtl4Q3URY0 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rtl4Q3URY0 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rtl4Q3URY0 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rtl4Q3URY0 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rtl4Q3URY0 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rtl4Q3URY0 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rtl4Q3URY0 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rtl4Q3URY0 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rtl4Q3URY0 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rtl4Q3URY0 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rtl4Q3URY0 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rtl4Q3URY0 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rtl4Q3URY0 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rtl4Q3URY0 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rtl4Q3URY0 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Rtl4Q3URY0 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rtl4Q3URY0 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rtl4Q3URY0 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rtl4Q3URY0 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Rtl4Q3URY0 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rtl4Q3URY0 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rtl4Q3URY0 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rtl4Q3URY0 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rtl4Q3URY0 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rtl4Q3URY0 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rtl4Q3URY0 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rtl4Q3URY0 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rtl4Q3URY0 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rtl4Q3URY0 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rtl4Q3URY0 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rtl4Q3URY0 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rtl4Q3URY0 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rtl4Q3URY0 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rtl4Q3URY0 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rtl4Q3URY0 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rtl4Q3URY0 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rtl4Q3URY0 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rtl4Q3URY0 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rtl4Q3URY0 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rtl4Q3URY0 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rtl4Q3URY0 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rtl4Q3URY0 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rtl4Q3URY0 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rtl4Q3URY0 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rtl4Q3URY0 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rtl4Q3URY0 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rtl4Q3URY0 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rtl4Q3URY0 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rtl4Q3URY0 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms