Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGR5

Hdhd2, Haloacid dehalogenase-like hydrolase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdhd2Q3UGR5 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hdhd2Q3UGR5 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Hdhd2Q3UGR5 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hdhd2Q3UGR5 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hdhd2Q3UGR5 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hdhd2Q3UGR5 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hdhd2Q3UGR5 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hdhd2Q3UGR5 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hdhd2Q3UGR5 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hdhd2Q3UGR5 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hdhd2Q3UGR5 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hdhd2Q3UGR5 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hdhd2Q3UGR5 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hdhd2Q3UGR5 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hdhd2Q3UGR5 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hdhd2Q3UGR5 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hdhd2Q3UGR5 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hdhd2Q3UGR5 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hdhd2Q3UGR5 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hdhd2Q3UGR5 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hdhd2Q3UGR5 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hdhd2Q3UGR5 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hdhd2Q3UGR5 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hdhd2Q3UGR5 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hdhd2Q3UGR5 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hdhd2Q3UGR5 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hdhd2Q3UGR5 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hdhd2Q3UGR5 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hdhd2Q3UGR5 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hdhd2Q3UGR5 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hdhd2Q3UGR5 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hdhd2Q3UGR5 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hdhd2Q3UGR5 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hdhd2Q3UGR5 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hdhd2Q3UGR5 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hdhd2Q3UGR5 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hdhd2Q3UGR5 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hdhd2Q3UGR5 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hdhd2Q3UGR5 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hdhd2Q3UGR5 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hdhd2Q3UGR5 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hdhd2Q3UGR5 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hdhd2Q3UGR5 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hdhd2Q3UGR5 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hdhd2Q3UGR5 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Hdhd2Q3UGR5 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hdhd2Q3UGR5 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hdhd2Q3UGR5 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hdhd2Q3UGR5 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hdhd2Q3UGR5 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hdhd2Q3UGR5 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hdhd2Q3UGR5 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hdhd2Q3UGR5 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hdhd2Q3UGR5 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hdhd2Q3UGR5 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hdhd2Q3UGR5 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Hdhd2Q3UGR5 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Hdhd2Q3UGR5 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hdhd2Q3UGR5 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hdhd2Q3UGR5 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hdhd2Q3UGR5 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hdhd2Q3UGR5 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hdhd2Q3UGR5 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hdhd2Q3UGR5 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hdhd2Q3UGR5 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Hdhd2Q3UGR5 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hdhd2Q3UGR5 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hdhd2Q3UGR5 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hdhd2Q3UGR5 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hdhd2Q3UGR5 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hdhd2Q3UGR5 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hdhd2Q3UGR5 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hdhd2Q3UGR5 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hdhd2Q3UGR5 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hdhd2Q3UGR5 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hdhd2Q3UGR5 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hdhd2Q3UGR5 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hdhd2Q3UGR5 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hdhd2Q3UGR5 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hdhd2Q3UGR5 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hdhd2Q3UGR5 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hdhd2Q3UGR5 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hdhd2Q3UGR5 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hdhd2Q3UGR5 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hdhd2Q3UGR5 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hdhd2Q3UGR5 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hdhd2Q3UGR5 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hdhd2Q3UGR5 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hdhd2Q3UGR5 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hdhd2Q3UGR5 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hdhd2Q3UGR5 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hdhd2Q3UGR5 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hdhd2Q3UGR5 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hdhd2Q3UGR5 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hdhd2Q3UGR5 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Hdhd2Q3UGR5 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hdhd2Q3UGR5 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hdhd2Q3UGR5 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hdhd2Q3UGR5 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hdhd2Q3UGR5 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.4 ms