Protein–RNA interactions for Protein: Q3TJD7

Pdlim7, PDZ and LIM domain protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdlim7Q3TJD7 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pdlim7Q3TJD7 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pdlim7Q3TJD7 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Pdlim7Q3TJD7 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pdlim7Q3TJD7 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pdlim7Q3TJD7 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pdlim7Q3TJD7 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pdlim7Q3TJD7 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pdlim7Q3TJD7 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pdlim7Q3TJD7 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pdlim7Q3TJD7 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pdlim7Q3TJD7 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Pdlim7Q3TJD7 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pdlim7Q3TJD7 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pdlim7Q3TJD7 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Pdlim7Q3TJD7 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pdlim7Q3TJD7 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pdlim7Q3TJD7 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pdlim7Q3TJD7 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pdlim7Q3TJD7 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Pdlim7Q3TJD7 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pdlim7Q3TJD7 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pdlim7Q3TJD7 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pdlim7Q3TJD7 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pdlim7Q3TJD7 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pdlim7Q3TJD7 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pdlim7Q3TJD7 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pdlim7Q3TJD7 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pdlim7Q3TJD7 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pdlim7Q3TJD7 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pdlim7Q3TJD7 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pdlim7Q3TJD7 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pdlim7Q3TJD7 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pdlim7Q3TJD7 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Pdlim7Q3TJD7 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pdlim7Q3TJD7 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pdlim7Q3TJD7 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pdlim7Q3TJD7 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pdlim7Q3TJD7 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Pdlim7Q3TJD7 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pdlim7Q3TJD7 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pdlim7Q3TJD7 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Pdlim7Q3TJD7 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Pdlim7Q3TJD7 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pdlim7Q3TJD7 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pdlim7Q3TJD7 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pdlim7Q3TJD7 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pdlim7Q3TJD7 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pdlim7Q3TJD7 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Pdlim7Q3TJD7 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pdlim7Q3TJD7 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pdlim7Q3TJD7 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Pdlim7Q3TJD7 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pdlim7Q3TJD7 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pdlim7Q3TJD7 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pdlim7Q3TJD7 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pdlim7Q3TJD7 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pdlim7Q3TJD7 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pdlim7Q3TJD7 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pdlim7Q3TJD7 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pdlim7Q3TJD7 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pdlim7Q3TJD7 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pdlim7Q3TJD7 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pdlim7Q3TJD7 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pdlim7Q3TJD7 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pdlim7Q3TJD7 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pdlim7Q3TJD7 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pdlim7Q3TJD7 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pdlim7Q3TJD7 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pdlim7Q3TJD7 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pdlim7Q3TJD7 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pdlim7Q3TJD7 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pdlim7Q3TJD7 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pdlim7Q3TJD7 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pdlim7Q3TJD7 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pdlim7Q3TJD7 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pdlim7Q3TJD7 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pdlim7Q3TJD7 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pdlim7Q3TJD7 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pdlim7Q3TJD7 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pdlim7Q3TJD7 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pdlim7Q3TJD7 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pdlim7Q3TJD7 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pdlim7Q3TJD7 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pdlim7Q3TJD7 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pdlim7Q3TJD7 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pdlim7Q3TJD7 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pdlim7Q3TJD7 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pdlim7Q3TJD7 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pdlim7Q3TJD7 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pdlim7Q3TJD7 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pdlim7Q3TJD7 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pdlim7Q3TJD7 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Pdlim7Q3TJD7 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Pdlim7Q3TJD7 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pdlim7Q3TJD7 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pdlim7Q3TJD7 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pdlim7Q3TJD7 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pdlim7Q3TJD7 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Pdlim7Q3TJD7 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.1 ms