Protein–RNA interactions for Protein: Q2PZL6

Fat4, Protocadherin Fat 4, mousemouse

Predictions only

Length 4,981 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fat4Q2PZL6 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fat4Q2PZL6 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fat4Q2PZL6 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fat4Q2PZL6 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fat4Q2PZL6 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fat4Q2PZL6 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Fat4Q2PZL6 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fat4Q2PZL6 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fat4Q2PZL6 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fat4Q2PZL6 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fat4Q2PZL6 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Fat4Q2PZL6 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fat4Q2PZL6 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fat4Q2PZL6 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fat4Q2PZL6 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Fat4Q2PZL6 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fat4Q2PZL6 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fat4Q2PZL6 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fat4Q2PZL6 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fat4Q2PZL6 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fat4Q2PZL6 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fat4Q2PZL6 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fat4Q2PZL6 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fat4Q2PZL6 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fat4Q2PZL6 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fat4Q2PZL6 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fat4Q2PZL6 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fat4Q2PZL6 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fat4Q2PZL6 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fat4Q2PZL6 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fat4Q2PZL6 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Fat4Q2PZL6 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fat4Q2PZL6 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fat4Q2PZL6 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fat4Q2PZL6 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fat4Q2PZL6 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fat4Q2PZL6 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fat4Q2PZL6 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fat4Q2PZL6 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fat4Q2PZL6 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fat4Q2PZL6 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fat4Q2PZL6 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Fat4Q2PZL6 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Fat4Q2PZL6 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Fat4Q2PZL6 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Fat4Q2PZL6 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Fat4Q2PZL6 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Fat4Q2PZL6 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Fat4Q2PZL6 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Fat4Q2PZL6 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Fat4Q2PZL6 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Fat4Q2PZL6 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Fat4Q2PZL6 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Fat4Q2PZL6 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Fat4Q2PZL6 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Fat4Q2PZL6 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Fat4Q2PZL6 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Fat4Q2PZL6 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Fat4Q2PZL6 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Fat4Q2PZL6 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Fat4Q2PZL6 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Fat4Q2PZL6 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Fat4Q2PZL6 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Fat4Q2PZL6 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Fat4Q2PZL6 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Fat4Q2PZL6 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Fat4Q2PZL6 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Fat4Q2PZL6 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Fat4Q2PZL6 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Fat4Q2PZL6 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Fat4Q2PZL6 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Fat4Q2PZL6 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Fat4Q2PZL6 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Fat4Q2PZL6 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Fat4Q2PZL6 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Fat4Q2PZL6 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Fat4Q2PZL6 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Fat4Q2PZL6 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Fat4Q2PZL6 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Fat4Q2PZL6 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Fat4Q2PZL6 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Fat4Q2PZL6 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Fat4Q2PZL6 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Fat4Q2PZL6 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Fat4Q2PZL6 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Fat4Q2PZL6 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Fat4Q2PZL6 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Fat4Q2PZL6 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Fat4Q2PZL6 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Fat4Q2PZL6 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Fat4Q2PZL6 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Fat4Q2PZL6 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Fat4Q2PZL6 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Fat4Q2PZL6 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Fat4Q2PZL6 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Fat4Q2PZL6 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Fat4Q2PZL6 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Fat4Q2PZL6 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Fat4Q2PZL6 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Fat4Q2PZL6 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
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