Protein–RNA interactions for Protein: Q2KN98

Specc1l, Cytospin-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Specc1lQ2KN98 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Specc1lQ2KN98 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Specc1lQ2KN98 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Specc1lQ2KN98 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Specc1lQ2KN98 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Specc1lQ2KN98 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Specc1lQ2KN98 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Specc1lQ2KN98 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Specc1lQ2KN98 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Specc1lQ2KN98 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Specc1lQ2KN98 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Specc1lQ2KN98 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Specc1lQ2KN98 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Specc1lQ2KN98 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Specc1lQ2KN98 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Specc1lQ2KN98 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Specc1lQ2KN98 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Specc1lQ2KN98 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Specc1lQ2KN98 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Specc1lQ2KN98 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Specc1lQ2KN98 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Specc1lQ2KN98 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Specc1lQ2KN98 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Specc1lQ2KN98 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Specc1lQ2KN98 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Specc1lQ2KN98 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Specc1lQ2KN98 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Specc1lQ2KN98 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Specc1lQ2KN98 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Specc1lQ2KN98 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Specc1lQ2KN98 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Specc1lQ2KN98 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Specc1lQ2KN98 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Specc1lQ2KN98 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Specc1lQ2KN98 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Specc1lQ2KN98 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Specc1lQ2KN98 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Specc1lQ2KN98 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Specc1lQ2KN98 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Specc1lQ2KN98 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Specc1lQ2KN98 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Specc1lQ2KN98 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Specc1lQ2KN98 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Specc1lQ2KN98 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Specc1lQ2KN98 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Specc1lQ2KN98 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Specc1lQ2KN98 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Specc1lQ2KN98 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Specc1lQ2KN98 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Specc1lQ2KN98 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Specc1lQ2KN98 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Specc1lQ2KN98 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Specc1lQ2KN98 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Specc1lQ2KN98 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Specc1lQ2KN98 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Specc1lQ2KN98 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Specc1lQ2KN98 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Specc1lQ2KN98 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Specc1lQ2KN98 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Specc1lQ2KN98 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Specc1lQ2KN98 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Specc1lQ2KN98 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Specc1lQ2KN98 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Specc1lQ2KN98 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Specc1lQ2KN98 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Specc1lQ2KN98 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Specc1lQ2KN98 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Specc1lQ2KN98 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Specc1lQ2KN98 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Specc1lQ2KN98 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Specc1lQ2KN98 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Specc1lQ2KN98 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Specc1lQ2KN98 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Specc1lQ2KN98 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Specc1lQ2KN98 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Specc1lQ2KN98 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Specc1lQ2KN98 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Specc1lQ2KN98 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Specc1lQ2KN98 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Specc1lQ2KN98 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Specc1lQ2KN98 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Specc1lQ2KN98 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Specc1lQ2KN98 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Specc1lQ2KN98 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Specc1lQ2KN98 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Specc1lQ2KN98 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Specc1lQ2KN98 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Specc1lQ2KN98 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Specc1lQ2KN98 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Specc1lQ2KN98 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Specc1lQ2KN98 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Specc1lQ2KN98 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Specc1lQ2KN98 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Specc1lQ2KN98 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Specc1lQ2KN98 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Specc1lQ2KN98 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Specc1lQ2KN98 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Specc1lQ2KN98 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Specc1lQ2KN98 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Specc1lQ2KN98 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms