Protein–RNA interactions for Protein: Q02067

Ascl1, Achaete-scute homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl1Q02067 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ascl1Q02067 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ascl1Q02067 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ascl1Q02067 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ascl1Q02067 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ascl1Q02067 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ascl1Q02067 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ascl1Q02067 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ascl1Q02067 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ascl1Q02067 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ascl1Q02067 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ascl1Q02067 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ascl1Q02067 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ascl1Q02067 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ascl1Q02067 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ascl1Q02067 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ascl1Q02067 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ascl1Q02067 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ascl1Q02067 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ascl1Q02067 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ascl1Q02067 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ascl1Q02067 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ascl1Q02067 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ascl1Q02067 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ascl1Q02067 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ascl1Q02067 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ascl1Q02067 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ascl1Q02067 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ascl1Q02067 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ascl1Q02067 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ascl1Q02067 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ascl1Q02067 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Ascl1Q02067 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Ascl1Q02067 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Ascl1Q02067 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ascl1Q02067 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ascl1Q02067 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ascl1Q02067 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ascl1Q02067 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ascl1Q02067 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ascl1Q02067 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ascl1Q02067 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ascl1Q02067 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ascl1Q02067 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ascl1Q02067 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ascl1Q02067 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ascl1Q02067 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ascl1Q02067 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ascl1Q02067 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ascl1Q02067 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ascl1Q02067 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ascl1Q02067 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ascl1Q02067 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ascl1Q02067 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ascl1Q02067 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ascl1Q02067 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ascl1Q02067 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ascl1Q02067 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ascl1Q02067 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ascl1Q02067 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ascl1Q02067 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ascl1Q02067 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ascl1Q02067 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ascl1Q02067 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ascl1Q02067 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ascl1Q02067 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ascl1Q02067 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ascl1Q02067 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ascl1Q02067 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ascl1Q02067 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ascl1Q02067 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ascl1Q02067 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ascl1Q02067 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ascl1Q02067 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ascl1Q02067 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ascl1Q02067 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ascl1Q02067 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ascl1Q02067 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ascl1Q02067 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ascl1Q02067 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ascl1Q02067 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ascl1Q02067 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ascl1Q02067 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ascl1Q02067 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ascl1Q02067 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ascl1Q02067 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ascl1Q02067 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ascl1Q02067 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ascl1Q02067 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ascl1Q02067 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Ascl1Q02067 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ascl1Q02067 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ascl1Q02067 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ascl1Q02067 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ascl1Q02067 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ascl1Q02067 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ascl1Q02067 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ascl1Q02067 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ascl1Q02067 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ascl1Q02067 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 128.8 ms