Protein–RNA interactions for Protein: Q000W5

Gbp10, Guanylate-binding protein 10, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp10Q000W5 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Gbp10Q000W5 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gbp10Q000W5 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gbp10Q000W5 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gbp10Q000W5 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Gbp10Q000W5 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Gbp10Q000W5 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gbp10Q000W5 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gbp10Q000W5 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Gbp10Q000W5 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Gbp10Q000W5 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gbp10Q000W5 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gbp10Q000W5 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gbp10Q000W5 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gbp10Q000W5 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gbp10Q000W5 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gbp10Q000W5 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gbp10Q000W5 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gbp10Q000W5 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gbp10Q000W5 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Gbp10Q000W5 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Gbp10Q000W5 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gbp10Q000W5 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Gbp10Q000W5 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Gbp10Q000W5 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gbp10Q000W5 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gbp10Q000W5 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gbp10Q000W5 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gbp10Q000W5 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gbp10Q000W5 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gbp10Q000W5 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gbp10Q000W5 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gbp10Q000W5 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gbp10Q000W5 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gbp10Q000W5 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gbp10Q000W5 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gbp10Q000W5 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gbp10Q000W5 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gbp10Q000W5 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gbp10Q000W5 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gbp10Q000W5 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gbp10Q000W5 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gbp10Q000W5 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gbp10Q000W5 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gbp10Q000W5 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gbp10Q000W5 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gbp10Q000W5 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gbp10Q000W5 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gbp10Q000W5 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gbp10Q000W5 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gbp10Q000W5 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gbp10Q000W5 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Gbp10Q000W5 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gbp10Q000W5 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Gbp10Q000W5 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gbp10Q000W5 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Gbp10Q000W5 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gbp10Q000W5 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gbp10Q000W5 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gbp10Q000W5 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gbp10Q000W5 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gbp10Q000W5 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gbp10Q000W5 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gbp10Q000W5 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gbp10Q000W5 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gbp10Q000W5 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gbp10Q000W5 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gbp10Q000W5 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gbp10Q000W5 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gbp10Q000W5 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gbp10Q000W5 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gbp10Q000W5 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gbp10Q000W5 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gbp10Q000W5 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gbp10Q000W5 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gbp10Q000W5 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gbp10Q000W5 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gbp10Q000W5 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gbp10Q000W5 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gbp10Q000W5 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gbp10Q000W5 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gbp10Q000W5 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gbp10Q000W5 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gbp10Q000W5 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gbp10Q000W5 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gbp10Q000W5 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gbp10Q000W5 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gbp10Q000W5 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Gbp10Q000W5 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gbp10Q000W5 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Gbp10Q000W5 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gbp10Q000W5 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gbp10Q000W5 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gbp10Q000W5 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gbp10Q000W5 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gbp10Q000W5 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gbp10Q000W5 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gbp10Q000W5 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gbp10Q000W5 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gbp10Q000W5 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms