Protein–RNA interactions for Protein: P98156

Vldlr, Very low-density lipoprotein receptor, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VldlrP98156 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
VldlrP98156 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
VldlrP98156 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
VldlrP98156 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
VldlrP98156 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
VldlrP98156 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
VldlrP98156 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
VldlrP98156 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
VldlrP98156 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
VldlrP98156 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
VldlrP98156 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
VldlrP98156 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
VldlrP98156 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
VldlrP98156 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
VldlrP98156 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
VldlrP98156 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
VldlrP98156 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
VldlrP98156 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
VldlrP98156 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
VldlrP98156 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
VldlrP98156 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
VldlrP98156 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
VldlrP98156 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
VldlrP98156 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
VldlrP98156 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
VldlrP98156 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
VldlrP98156 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
VldlrP98156 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
VldlrP98156 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
VldlrP98156 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
VldlrP98156 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
VldlrP98156 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
VldlrP98156 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
VldlrP98156 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
VldlrP98156 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
VldlrP98156 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
VldlrP98156 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
VldlrP98156 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
VldlrP98156 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
VldlrP98156 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
VldlrP98156 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
VldlrP98156 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
VldlrP98156 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
VldlrP98156 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
VldlrP98156 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
VldlrP98156 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
VldlrP98156 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
VldlrP98156 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
VldlrP98156 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
VldlrP98156 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
VldlrP98156 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
VldlrP98156 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
VldlrP98156 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
VldlrP98156 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
VldlrP98156 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
VldlrP98156 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
VldlrP98156 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
VldlrP98156 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
VldlrP98156 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
VldlrP98156 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
VldlrP98156 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
VldlrP98156 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
VldlrP98156 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
VldlrP98156 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
VldlrP98156 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
VldlrP98156 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
VldlrP98156 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
VldlrP98156 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
VldlrP98156 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
VldlrP98156 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
VldlrP98156 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
VldlrP98156 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
VldlrP98156 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
VldlrP98156 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
VldlrP98156 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
VldlrP98156 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
VldlrP98156 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
VldlrP98156 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
VldlrP98156 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
VldlrP98156 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
VldlrP98156 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
VldlrP98156 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
VldlrP98156 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
VldlrP98156 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
VldlrP98156 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
VldlrP98156 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
VldlrP98156 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
VldlrP98156 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
VldlrP98156 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
VldlrP98156 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
VldlrP98156 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
VldlrP98156 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
VldlrP98156 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
VldlrP98156 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
VldlrP98156 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
VldlrP98156 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
VldlrP98156 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
VldlrP98156 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
VldlrP98156 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
VldlrP98156 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1183.9 ms