Protein–RNA interactions for Protein: P98084

Apba2, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 2, mousemouse

Predictions only

Length 750 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apba2P98084 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Apba2P98084 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Apba2P98084 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Apba2P98084 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Apba2P98084 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Apba2P98084 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Apba2P98084 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Apba2P98084 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Apba2P98084 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Apba2P98084 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Apba2P98084 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Apba2P98084 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Apba2P98084 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Apba2P98084 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Apba2P98084 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Apba2P98084 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Apba2P98084 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Apba2P98084 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Apba2P98084 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Apba2P98084 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Apba2P98084 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Apba2P98084 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Apba2P98084 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Apba2P98084 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Apba2P98084 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Apba2P98084 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Apba2P98084 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Apba2P98084 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Apba2P98084 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Apba2P98084 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Apba2P98084 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Apba2P98084 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Apba2P98084 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Apba2P98084 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Apba2P98084 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Apba2P98084 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Apba2P98084 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Apba2P98084 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Apba2P98084 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Apba2P98084 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Apba2P98084 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Apba2P98084 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Apba2P98084 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Apba2P98084 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Apba2P98084 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Apba2P98084 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Apba2P98084 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Apba2P98084 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Apba2P98084 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Apba2P98084 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Apba2P98084 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Apba2P98084 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Apba2P98084 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Apba2P98084 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Apba2P98084 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Apba2P98084 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Apba2P98084 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Apba2P98084 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Apba2P98084 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Apba2P98084 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Apba2P98084 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Apba2P98084 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Apba2P98084 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Apba2P98084 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Apba2P98084 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Apba2P98084 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Apba2P98084 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Apba2P98084 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Apba2P98084 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Apba2P98084 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Apba2P98084 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Apba2P98084 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Apba2P98084 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Apba2P98084 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Apba2P98084 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Apba2P98084 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Apba2P98084 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Apba2P98084 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Apba2P98084 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Apba2P98084 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Apba2P98084 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Apba2P98084 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Apba2P98084 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Apba2P98084 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Apba2P98084 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Apba2P98084 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Apba2P98084 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Apba2P98084 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Apba2P98084 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Apba2P98084 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Apba2P98084 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Apba2P98084 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Apba2P98084 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Apba2P98084 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Apba2P98084 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Apba2P98084 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Apba2P98084 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Apba2P98084 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Apba2P98084 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Apba2P98084 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.7 ms