Protein–RNA interactions for Protein: P97474

Pitx2, Pituitary homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx2P97474 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pitx2P97474 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pitx2P97474 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pitx2P97474 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pitx2P97474 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pitx2P97474 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pitx2P97474 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pitx2P97474 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pitx2P97474 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pitx2P97474 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pitx2P97474 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pitx2P97474 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pitx2P97474 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pitx2P97474 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pitx2P97474 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pitx2P97474 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pitx2P97474 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pitx2P97474 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pitx2P97474 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pitx2P97474 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pitx2P97474 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pitx2P97474 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pitx2P97474 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pitx2P97474 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pitx2P97474 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pitx2P97474 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pitx2P97474 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pitx2P97474 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pitx2P97474 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Pitx2P97474 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pitx2P97474 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pitx2P97474 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pitx2P97474 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pitx2P97474 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pitx2P97474 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pitx2P97474 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pitx2P97474 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pitx2P97474 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pitx2P97474 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pitx2P97474 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pitx2P97474 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pitx2P97474 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pitx2P97474 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pitx2P97474 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pitx2P97474 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pitx2P97474 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pitx2P97474 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pitx2P97474 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pitx2P97474 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pitx2P97474 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pitx2P97474 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Pitx2P97474 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pitx2P97474 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pitx2P97474 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pitx2P97474 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pitx2P97474 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pitx2P97474 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pitx2P97474 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pitx2P97474 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pitx2P97474 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pitx2P97474 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pitx2P97474 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pitx2P97474 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pitx2P97474 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pitx2P97474 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pitx2P97474 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Pitx2P97474 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pitx2P97474 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pitx2P97474 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pitx2P97474 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Pitx2P97474 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pitx2P97474 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Pitx2P97474 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pitx2P97474 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pitx2P97474 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pitx2P97474 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pitx2P97474 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pitx2P97474 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Pitx2P97474 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Pitx2P97474 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pitx2P97474 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pitx2P97474 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pitx2P97474 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pitx2P97474 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pitx2P97474 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pitx2P97474 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pitx2P97474 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pitx2P97474 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pitx2P97474 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pitx2P97474 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pitx2P97474 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pitx2P97474 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pitx2P97474 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pitx2P97474 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pitx2P97474 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pitx2P97474 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pitx2P97474 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pitx2P97474 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pitx2P97474 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pitx2P97474 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106 ms