Protein–RNA interactions for Protein: P63089

Ptn, Pleiotrophin, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtnP63089 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PtnP63089 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PtnP63089 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PtnP63089 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
PtnP63089 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PtnP63089 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PtnP63089 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PtnP63089 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PtnP63089 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PtnP63089 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PtnP63089 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PtnP63089 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PtnP63089 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PtnP63089 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PtnP63089 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PtnP63089 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PtnP63089 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PtnP63089 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PtnP63089 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PtnP63089 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PtnP63089 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PtnP63089 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PtnP63089 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PtnP63089 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PtnP63089 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PtnP63089 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PtnP63089 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PtnP63089 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PtnP63089 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PtnP63089 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PtnP63089 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PtnP63089 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PtnP63089 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PtnP63089 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PtnP63089 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PtnP63089 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PtnP63089 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PtnP63089 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PtnP63089 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PtnP63089 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PtnP63089 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PtnP63089 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PtnP63089 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PtnP63089 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PtnP63089 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PtnP63089 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PtnP63089 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PtnP63089 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PtnP63089 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PtnP63089 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PtnP63089 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PtnP63089 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PtnP63089 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PtnP63089 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PtnP63089 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PtnP63089 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PtnP63089 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PtnP63089 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PtnP63089 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
PtnP63089 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
PtnP63089 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PtnP63089 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PtnP63089 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PtnP63089 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PtnP63089 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
PtnP63089 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PtnP63089 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PtnP63089 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PtnP63089 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PtnP63089 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PtnP63089 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PtnP63089 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
PtnP63089 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
PtnP63089 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PtnP63089 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PtnP63089 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PtnP63089 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PtnP63089 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PtnP63089 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PtnP63089 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PtnP63089 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PtnP63089 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PtnP63089 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PtnP63089 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PtnP63089 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PtnP63089 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PtnP63089 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PtnP63089 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PtnP63089 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PtnP63089 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PtnP63089 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PtnP63089 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PtnP63089 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PtnP63089 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PtnP63089 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PtnP63089 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
PtnP63089 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PtnP63089 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PtnP63089 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PtnP63089 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 206.1 ms