Protein–RNA interactions for Protein: P59242

Cgn, Cingulin, mousemouse

Predictions only

Length 1,191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CgnP59242 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CgnP59242 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CgnP59242 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CgnP59242 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CgnP59242 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CgnP59242 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CgnP59242 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CgnP59242 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CgnP59242 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CgnP59242 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CgnP59242 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CgnP59242 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CgnP59242 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CgnP59242 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CgnP59242 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CgnP59242 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CgnP59242 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CgnP59242 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CgnP59242 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CgnP59242 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CgnP59242 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CgnP59242 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CgnP59242 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CgnP59242 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CgnP59242 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CgnP59242 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CgnP59242 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CgnP59242 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CgnP59242 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CgnP59242 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CgnP59242 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CgnP59242 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CgnP59242 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CgnP59242 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CgnP59242 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CgnP59242 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CgnP59242 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CgnP59242 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CgnP59242 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CgnP59242 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CgnP59242 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CgnP59242 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CgnP59242 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CgnP59242 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CgnP59242 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CgnP59242 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CgnP59242 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CgnP59242 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CgnP59242 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CgnP59242 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CgnP59242 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CgnP59242 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CgnP59242 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CgnP59242 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CgnP59242 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CgnP59242 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CgnP59242 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CgnP59242 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CgnP59242 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CgnP59242 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CgnP59242 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CgnP59242 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CgnP59242 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CgnP59242 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CgnP59242 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CgnP59242 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CgnP59242 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CgnP59242 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CgnP59242 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CgnP59242 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CgnP59242 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CgnP59242 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CgnP59242 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CgnP59242 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
CgnP59242 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CgnP59242 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CgnP59242 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CgnP59242 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CgnP59242 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CgnP59242 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CgnP59242 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CgnP59242 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CgnP59242 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CgnP59242 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CgnP59242 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CgnP59242 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CgnP59242 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CgnP59242 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CgnP59242 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CgnP59242 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CgnP59242 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CgnP59242 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CgnP59242 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CgnP59242 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CgnP59242 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CgnP59242 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CgnP59242 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CgnP59242 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CgnP59242 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CgnP59242 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms