Protein–RNA interactions for Protein: P56399

Usp5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp5P56399 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Usp5P56399 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Usp5P56399 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Usp5P56399 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Usp5P56399 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Usp5P56399 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Usp5P56399 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Usp5P56399 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Usp5P56399 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Usp5P56399 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Usp5P56399 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Usp5P56399 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Usp5P56399 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Usp5P56399 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Usp5P56399 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Usp5P56399 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Usp5P56399 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Usp5P56399 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Usp5P56399 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Usp5P56399 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Usp5P56399 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Usp5P56399 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Usp5P56399 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Usp5P56399 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Usp5P56399 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Usp5P56399 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Usp5P56399 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Usp5P56399 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Usp5P56399 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Usp5P56399 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Usp5P56399 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Usp5P56399 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Usp5P56399 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Usp5P56399 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Usp5P56399 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Usp5P56399 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Usp5P56399 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Usp5P56399 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Usp5P56399 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Usp5P56399 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Usp5P56399 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Usp5P56399 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Usp5P56399 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Usp5P56399 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Usp5P56399 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Usp5P56399 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Usp5P56399 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Usp5P56399 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Usp5P56399 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Usp5P56399 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Usp5P56399 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Usp5P56399 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Usp5P56399 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Usp5P56399 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Usp5P56399 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Usp5P56399 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Usp5P56399 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Usp5P56399 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Usp5P56399 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Usp5P56399 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
Usp5P56399 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Usp5P56399 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Usp5P56399 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Usp5P56399 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Usp5P56399 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Usp5P56399 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Usp5P56399 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Usp5P56399 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Usp5P56399 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Usp5P56399 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Usp5P56399 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Usp5P56399 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Usp5P56399 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Usp5P56399 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Usp5P56399 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Usp5P56399 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Usp5P56399 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Usp5P56399 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Usp5P56399 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Usp5P56399 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Usp5P56399 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Usp5P56399 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Usp5P56399 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Usp5P56399 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Usp5P56399 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Usp5P56399 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Usp5P56399 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Usp5P56399 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Usp5P56399 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Usp5P56399 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Usp5P56399 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Usp5P56399 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Usp5P56399 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Usp5P56399 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Usp5P56399 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Usp5P56399 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Usp5P56399 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Usp5P56399 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Usp5P56399 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Usp5P56399 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 308.5 ms