Protein–RNA interactions for Protein: P56183

Rrp1, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp1P56183 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rrp1P56183 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rrp1P56183 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rrp1P56183 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rrp1P56183 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rrp1P56183 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rrp1P56183 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rrp1P56183 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Rrp1P56183 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rrp1P56183 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rrp1P56183 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rrp1P56183 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rrp1P56183 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rrp1P56183 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rrp1P56183 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rrp1P56183 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rrp1P56183 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rrp1P56183 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rrp1P56183 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rrp1P56183 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rrp1P56183 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rrp1P56183 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rrp1P56183 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rrp1P56183 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rrp1P56183 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rrp1P56183 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rrp1P56183 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rrp1P56183 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rrp1P56183 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rrp1P56183 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rrp1P56183 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Rrp1P56183 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rrp1P56183 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rrp1P56183 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rrp1P56183 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rrp1P56183 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rrp1P56183 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rrp1P56183 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rrp1P56183 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rrp1P56183 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rrp1P56183 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rrp1P56183 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rrp1P56183 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rrp1P56183 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rrp1P56183 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rrp1P56183 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rrp1P56183 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rrp1P56183 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rrp1P56183 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rrp1P56183 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rrp1P56183 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rrp1P56183 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rrp1P56183 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rrp1P56183 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rrp1P56183 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rrp1P56183 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Rrp1P56183 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rrp1P56183 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rrp1P56183 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rrp1P56183 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rrp1P56183 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rrp1P56183 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rrp1P56183 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rrp1P56183 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rrp1P56183 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rrp1P56183 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rrp1P56183 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rrp1P56183 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rrp1P56183 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rrp1P56183 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rrp1P56183 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rrp1P56183 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rrp1P56183 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rrp1P56183 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rrp1P56183 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Rrp1P56183 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Rrp1P56183 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rrp1P56183 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rrp1P56183 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Rrp1P56183 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Rrp1P56183 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rrp1P56183 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rrp1P56183 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rrp1P56183 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rrp1P56183 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rrp1P56183 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rrp1P56183 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rrp1P56183 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rrp1P56183 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rrp1P56183 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rrp1P56183 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rrp1P56183 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rrp1P56183 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rrp1P56183 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rrp1P56183 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Rrp1P56183 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Rrp1P56183 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rrp1P56183 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rrp1P56183 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rrp1P56183 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106.3 ms