Protein–RNA interactions for Protein: P55065

Pltp, Phospholipid transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PltpP55065 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PltpP55065 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PltpP55065 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PltpP55065 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PltpP55065 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PltpP55065 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PltpP55065 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PltpP55065 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PltpP55065 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PltpP55065 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PltpP55065 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PltpP55065 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PltpP55065 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PltpP55065 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PltpP55065 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PltpP55065 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PltpP55065 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PltpP55065 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PltpP55065 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PltpP55065 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PltpP55065 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PltpP55065 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PltpP55065 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PltpP55065 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PltpP55065 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PltpP55065 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PltpP55065 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PltpP55065 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PltpP55065 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PltpP55065 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PltpP55065 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PltpP55065 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PltpP55065 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PltpP55065 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PltpP55065 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PltpP55065 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PltpP55065 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PltpP55065 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PltpP55065 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PltpP55065 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PltpP55065 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PltpP55065 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PltpP55065 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PltpP55065 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PltpP55065 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PltpP55065 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PltpP55065 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PltpP55065 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PltpP55065 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PltpP55065 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PltpP55065 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PltpP55065 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PltpP55065 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PltpP55065 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PltpP55065 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PltpP55065 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PltpP55065 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PltpP55065 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PltpP55065 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PltpP55065 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PltpP55065 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PltpP55065 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PltpP55065 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PltpP55065 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PltpP55065 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PltpP55065 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PltpP55065 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PltpP55065 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PltpP55065 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PltpP55065 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PltpP55065 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PltpP55065 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PltpP55065 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PltpP55065 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PltpP55065 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PltpP55065 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PltpP55065 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PltpP55065 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PltpP55065 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PltpP55065 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PltpP55065 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PltpP55065 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PltpP55065 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PltpP55065 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PltpP55065 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PltpP55065 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PltpP55065 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PltpP55065 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PltpP55065 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PltpP55065 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PltpP55065 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PltpP55065 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PltpP55065 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PltpP55065 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PltpP55065 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PltpP55065 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PltpP55065 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PltpP55065 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PltpP55065 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PltpP55065 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms