Protein–RNA interactions for Protein: P51670

Ccl9, C-C motif chemokine 9, mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl9P51670 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccl9P51670 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccl9P51670 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccl9P51670 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccl9P51670 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccl9P51670 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccl9P51670 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccl9P51670 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccl9P51670 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccl9P51670 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccl9P51670 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccl9P51670 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccl9P51670 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccl9P51670 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ccl9P51670 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ccl9P51670 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccl9P51670 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccl9P51670 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccl9P51670 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccl9P51670 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccl9P51670 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccl9P51670 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccl9P51670 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccl9P51670 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccl9P51670 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccl9P51670 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccl9P51670 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccl9P51670 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccl9P51670 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccl9P51670 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccl9P51670 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccl9P51670 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccl9P51670 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccl9P51670 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccl9P51670 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccl9P51670 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccl9P51670 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccl9P51670 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccl9P51670 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccl9P51670 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccl9P51670 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccl9P51670 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccl9P51670 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccl9P51670 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccl9P51670 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccl9P51670 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccl9P51670 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccl9P51670 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccl9P51670 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccl9P51670 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccl9P51670 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccl9P51670 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccl9P51670 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccl9P51670 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccl9P51670 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccl9P51670 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccl9P51670 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccl9P51670 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccl9P51670 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccl9P51670 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccl9P51670 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccl9P51670 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccl9P51670 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccl9P51670 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccl9P51670 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccl9P51670 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccl9P51670 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccl9P51670 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccl9P51670 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccl9P51670 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccl9P51670 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccl9P51670 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccl9P51670 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccl9P51670 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccl9P51670 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccl9P51670 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccl9P51670 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccl9P51670 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccl9P51670 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccl9P51670 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccl9P51670 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccl9P51670 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccl9P51670 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccl9P51670 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccl9P51670 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccl9P51670 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccl9P51670 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccl9P51670 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccl9P51670 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccl9P51670 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccl9P51670 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccl9P51670 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccl9P51670 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccl9P51670 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccl9P51670 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccl9P51670 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccl9P51670 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccl9P51670 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccl9P51670 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccl9P51670 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms