Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tmod1P49813 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tmod1P49813 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tmod1P49813 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tmod1P49813 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tmod1P49813 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tmod1P49813 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tmod1P49813 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tmod1P49813 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tmod1P49813 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tmod1P49813 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tmod1P49813 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tmod1P49813 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tmod1P49813 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tmod1P49813 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tmod1P49813 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tmod1P49813 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tmod1P49813 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tmod1P49813 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tmod1P49813 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tmod1P49813 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tmod1P49813 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tmod1P49813 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tmod1P49813 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tmod1P49813 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tmod1P49813 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Tmod1P49813 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tmod1P49813 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tmod1P49813 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tmod1P49813 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tmod1P49813 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tmod1P49813 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tmod1P49813 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tmod1P49813 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tmod1P49813 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tmod1P49813 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tmod1P49813 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tmod1P49813 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tmod1P49813 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tmod1P49813 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tmod1P49813 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tmod1P49813 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tmod1P49813 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tmod1P49813 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tmod1P49813 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tmod1P49813 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Tmod1P49813 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tmod1P49813 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tmod1P49813 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tmod1P49813 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tmod1P49813 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tmod1P49813 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tmod1P49813 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tmod1P49813 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tmod1P49813 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tmod1P49813 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tmod1P49813 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tmod1P49813 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tmod1P49813 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tmod1P49813 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tmod1P49813 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tmod1P49813 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tmod1P49813 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tmod1P49813 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tmod1P49813 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tmod1P49813 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tmod1P49813 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tmod1P49813 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tmod1P49813 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tmod1P49813 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tmod1P49813 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tmod1P49813 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tmod1P49813 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tmod1P49813 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tmod1P49813 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tmod1P49813 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tmod1P49813 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tmod1P49813 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tmod1P49813 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tmod1P49813 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tmod1P49813 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tmod1P49813 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tmod1P49813 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tmod1P49813 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tmod1P49813 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tmod1P49813 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tmod1P49813 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tmod1P49813 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tmod1P49813 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tmod1P49813 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tmod1P49813 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tmod1P49813 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tmod1P49813 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tmod1P49813 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tmod1P49813 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tmod1P49813 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tmod1P49813 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tmod1P49813 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tmod1P49813 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Tmod1P49813 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms