Protein–RNA interactions for Protein: P42582

Nkx2-5, Homeobox protein Nkx-2.5, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx2-5P42582 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nkx2-5P42582 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nkx2-5P42582 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nkx2-5P42582 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nkx2-5P42582 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nkx2-5P42582 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nkx2-5P42582 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nkx2-5P42582 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nkx2-5P42582 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nkx2-5P42582 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nkx2-5P42582 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nkx2-5P42582 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nkx2-5P42582 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nkx2-5P42582 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nkx2-5P42582 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nkx2-5P42582 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nkx2-5P42582 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nkx2-5P42582 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nkx2-5P42582 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nkx2-5P42582 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nkx2-5P42582 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nkx2-5P42582 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nkx2-5P42582 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nkx2-5P42582 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nkx2-5P42582 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nkx2-5P42582 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nkx2-5P42582 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nkx2-5P42582 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nkx2-5P42582 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nkx2-5P42582 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nkx2-5P42582 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nkx2-5P42582 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nkx2-5P42582 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nkx2-5P42582 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nkx2-5P42582 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nkx2-5P42582 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nkx2-5P42582 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nkx2-5P42582 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Nkx2-5P42582 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nkx2-5P42582 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nkx2-5P42582 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nkx2-5P42582 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nkx2-5P42582 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nkx2-5P42582 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nkx2-5P42582 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nkx2-5P42582 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nkx2-5P42582 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nkx2-5P42582 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nkx2-5P42582 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Nkx2-5P42582 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nkx2-5P42582 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nkx2-5P42582 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Nkx2-5P42582 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Nkx2-5P42582 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Nkx2-5P42582 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nkx2-5P42582 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nkx2-5P42582 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nkx2-5P42582 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nkx2-5P42582 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nkx2-5P42582 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Nkx2-5P42582 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nkx2-5P42582 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nkx2-5P42582 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nkx2-5P42582 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nkx2-5P42582 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nkx2-5P42582 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nkx2-5P42582 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nkx2-5P42582 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nkx2-5P42582 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nkx2-5P42582 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nkx2-5P42582 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nkx2-5P42582 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nkx2-5P42582 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nkx2-5P42582 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nkx2-5P42582 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nkx2-5P42582 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nkx2-5P42582 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nkx2-5P42582 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nkx2-5P42582 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nkx2-5P42582 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nkx2-5P42582 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nkx2-5P42582 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nkx2-5P42582 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nkx2-5P42582 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nkx2-5P42582 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nkx2-5P42582 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nkx2-5P42582 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nkx2-5P42582 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nkx2-5P42582 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nkx2-5P42582 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nkx2-5P42582 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nkx2-5P42582 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nkx2-5P42582 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nkx2-5P42582 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nkx2-5P42582 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nkx2-5P42582 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nkx2-5P42582 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Nkx2-5P42582 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nkx2-5P42582 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nkx2-5P42582 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.5 ms