Protein–RNA interactions for Protein: P42580

Nkx1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx1-2P42580 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Nkx1-2P42580 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Nkx1-2P42580 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Nkx1-2P42580 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Nkx1-2P42580 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Nkx1-2P42580 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Nkx1-2P42580 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Nkx1-2P42580 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nkx1-2P42580 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nkx1-2P42580 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nkx1-2P42580 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nkx1-2P42580 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nkx1-2P42580 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nkx1-2P42580 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Nkx1-2P42580 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Nkx1-2P42580 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Nkx1-2P42580 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Nkx1-2P42580 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Nkx1-2P42580 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Nkx1-2P42580 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Nkx1-2P42580 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Nkx1-2P42580 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Nkx1-2P42580 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Nkx1-2P42580 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Nkx1-2P42580 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Nkx1-2P42580 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Nkx1-2P42580 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Nkx1-2P42580 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Nkx1-2P42580 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Nkx1-2P42580 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Nkx1-2P42580 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Nkx1-2P42580 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Nkx1-2P42580 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Nkx1-2P42580 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Nkx1-2P42580 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Nkx1-2P42580 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Nkx1-2P42580 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Nkx1-2P42580 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Nkx1-2P42580 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Nkx1-2P42580 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Nkx1-2P42580 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Nkx1-2P42580 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Nkx1-2P42580 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Nkx1-2P42580 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Nkx1-2P42580 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Nkx1-2P42580 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Nkx1-2P42580 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Nkx1-2P42580 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Nkx1-2P42580 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Nkx1-2P42580 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Nkx1-2P42580 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Nkx1-2P42580 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Nkx1-2P42580 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Nkx1-2P42580 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Nkx1-2P42580 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Nkx1-2P42580 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Nkx1-2P42580 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Nkx1-2P42580 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Nkx1-2P42580 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Nkx1-2P42580 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Nkx1-2P42580 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Nkx1-2P42580 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Nkx1-2P42580 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Nkx1-2P42580 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Nkx1-2P42580 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Nkx1-2P42580 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Nkx1-2P42580 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Nkx1-2P42580 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Nkx1-2P42580 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Nkx1-2P42580 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Nkx1-2P42580 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Nkx1-2P42580 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Nkx1-2P42580 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Nkx1-2P42580 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Nkx1-2P42580 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Nkx1-2P42580 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Nkx1-2P42580 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Nkx1-2P42580 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Nkx1-2P42580 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Nkx1-2P42580 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Nkx1-2P42580 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Nkx1-2P42580 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Nkx1-2P42580 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Nkx1-2P42580 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Nkx1-2P42580 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Nkx1-2P42580 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Nkx1-2P42580 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Nkx1-2P42580 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Nkx1-2P42580 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Nkx1-2P42580 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Nkx1-2P42580 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Nkx1-2P42580 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Nkx1-2P42580 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Nkx1-2P42580 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Nkx1-2P42580 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Nkx1-2P42580 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Nkx1-2P42580 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Nkx1-2P42580 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Nkx1-2P42580 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Nkx1-2P42580 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 108.8 ms