Protein–RNA interactions for Protein: P40201

Chd1, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd1P40201 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Chd1P40201 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Chd1P40201 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
Chd1P40201 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Chd1P40201 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC32.65■■■□□ 2.82
Chd1P40201 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC32.65■■■□□ 2.82
Chd1P40201 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC32.65■■■□□ 2.82
Chd1P40201 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Chd1P40201 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC32.64■■■□□ 2.82
Chd1P40201 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Chd1P40201 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Chd1P40201 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC32.64■■■□□ 2.82
Chd1P40201 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
Chd1P40201 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Chd1P40201 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Chd1P40201 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Chd1P40201 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
Chd1P40201 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC32.63■■■□□ 2.81
Chd1P40201 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
Chd1P40201 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Chd1P40201 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Chd1P40201 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Chd1P40201 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
Chd1P40201 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Chd1P40201 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Chd1P40201 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Chd1P40201 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC32.61■■■□□ 2.81
Chd1P40201 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC32.61■■■□□ 2.81
Chd1P40201 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Chd1P40201 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Chd1P40201 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC32.6■■■□□ 2.81
Chd1P40201 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Chd1P40201 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
Chd1P40201 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Chd1P40201 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC32.6■■■□□ 2.81
Chd1P40201 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
Chd1P40201 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
Chd1P40201 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC32.6■■■□□ 2.81
Chd1P40201 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Chd1P40201 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
Chd1P40201 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
Chd1P40201 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
Chd1P40201 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Chd1P40201 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Chd1P40201 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC32.57■■■□□ 2.8
Chd1P40201 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
Chd1P40201 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
Chd1P40201 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
Chd1P40201 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Chd1P40201 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC32.55■■■□□ 2.8
Chd1P40201 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Chd1P40201 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Chd1P40201 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
Chd1P40201 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
Chd1P40201 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Chd1P40201 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
Chd1P40201 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Chd1P40201 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Chd1P40201 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
Chd1P40201 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Chd1P40201 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Chd1P40201 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC32.52■■■□□ 2.8
Chd1P40201 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Chd1P40201 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Chd1P40201 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Chd1P40201 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.8
Chd1P40201 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
Chd1P40201 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
Chd1P40201 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
Chd1P40201 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Chd1P40201 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
Chd1P40201 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
Chd1P40201 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.51■■■□□ 2.79
Chd1P40201 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.51■■■□□ 2.79
Chd1P40201 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
Chd1P40201 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Chd1P40201 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Chd1P40201 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Chd1P40201 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Chd1P40201 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC32.5■■■□□ 2.79
Chd1P40201 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC32.5■■■□□ 2.79
Chd1P40201 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC32.5■■■□□ 2.79
Chd1P40201 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC32.5■■■□□ 2.79
Chd1P40201 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Chd1P40201 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Chd1P40201 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
Chd1P40201 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Chd1P40201 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Chd1P40201 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Chd1P40201 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Chd1P40201 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC32.48■■■□□ 2.79
Chd1P40201 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Chd1P40201 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC32.47■■■□□ 2.79
Chd1P40201 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Chd1P40201 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Chd1P40201 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
Chd1P40201 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
Chd1P40201 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Chd1P40201 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Chd1P40201 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms