Protein–RNA interactions for Protein: P31310

Hoxa10, Homeobox protein Hox-A10, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa10P31310 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hoxa10P31310 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hoxa10P31310 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hoxa10P31310 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hoxa10P31310 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hoxa10P31310 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hoxa10P31310 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Hoxa10P31310 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hoxa10P31310 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hoxa10P31310 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hoxa10P31310 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hoxa10P31310 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hoxa10P31310 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hoxa10P31310 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hoxa10P31310 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Hoxa10P31310 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hoxa10P31310 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hoxa10P31310 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hoxa10P31310 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hoxa10P31310 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hoxa10P31310 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hoxa10P31310 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hoxa10P31310 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hoxa10P31310 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hoxa10P31310 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hoxa10P31310 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hoxa10P31310 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hoxa10P31310 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hoxa10P31310 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hoxa10P31310 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hoxa10P31310 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hoxa10P31310 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hoxa10P31310 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hoxa10P31310 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hoxa10P31310 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hoxa10P31310 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hoxa10P31310 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hoxa10P31310 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hoxa10P31310 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hoxa10P31310 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hoxa10P31310 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hoxa10P31310 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hoxa10P31310 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hoxa10P31310 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hoxa10P31310 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hoxa10P31310 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hoxa10P31310 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hoxa10P31310 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Hoxa10P31310 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hoxa10P31310 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hoxa10P31310 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hoxa10P31310 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hoxa10P31310 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hoxa10P31310 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hoxa10P31310 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Hoxa10P31310 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hoxa10P31310 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hoxa10P31310 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hoxa10P31310 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hoxa10P31310 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hoxa10P31310 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Hoxa10P31310 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hoxa10P31310 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hoxa10P31310 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hoxa10P31310 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hoxa10P31310 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hoxa10P31310 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hoxa10P31310 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hoxa10P31310 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hoxa10P31310 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hoxa10P31310 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hoxa10P31310 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hoxa10P31310 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hoxa10P31310 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hoxa10P31310 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hoxa10P31310 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hoxa10P31310 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hoxa10P31310 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hoxa10P31310 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hoxa10P31310 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hoxa10P31310 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hoxa10P31310 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hoxa10P31310 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Hoxa10P31310 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hoxa10P31310 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hoxa10P31310 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hoxa10P31310 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hoxa10P31310 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Hoxa10P31310 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hoxa10P31310 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hoxa10P31310 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hoxa10P31310 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hoxa10P31310 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hoxa10P31310 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hoxa10P31310 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hoxa10P31310 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hoxa10P31310 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Hoxa10P31310 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hoxa10P31310 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hoxa10P31310 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms