Protein–RNA interactions for Protein: P28741

Kif3a, Kinesin-like protein KIF3A, mousemouse

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif3aP28741 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Kif3aP28741 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Kif3aP28741 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Kif3aP28741 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Kif3aP28741 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Kif3aP28741 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Kif3aP28741 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Kif3aP28741 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Kif3aP28741 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Kif3aP28741 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Kif3aP28741 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Kif3aP28741 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Kif3aP28741 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Kif3aP28741 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Kif3aP28741 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Kif3aP28741 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Kif3aP28741 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Kif3aP28741 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Kif3aP28741 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Kif3aP28741 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Kif3aP28741 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Kif3aP28741 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Kif3aP28741 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Kif3aP28741 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Kif3aP28741 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Kif3aP28741 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Kif3aP28741 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Kif3aP28741 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Kif3aP28741 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Kif3aP28741 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Kif3aP28741 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Kif3aP28741 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Kif3aP28741 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Kif3aP28741 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Kif3aP28741 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Kif3aP28741 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Kif3aP28741 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Kif3aP28741 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Kif3aP28741 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Kif3aP28741 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Kif3aP28741 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Kif3aP28741 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Kif3aP28741 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Kif3aP28741 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Kif3aP28741 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Kif3aP28741 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Kif3aP28741 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Kif3aP28741 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Kif3aP28741 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Kif3aP28741 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Kif3aP28741 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Kif3aP28741 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Kif3aP28741 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Kif3aP28741 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Kif3aP28741 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Kif3aP28741 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Kif3aP28741 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Kif3aP28741 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Kif3aP28741 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Kif3aP28741 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Kif3aP28741 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Kif3aP28741 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Kif3aP28741 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Kif3aP28741 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Kif3aP28741 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Kif3aP28741 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Kif3aP28741 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Kif3aP28741 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Kif3aP28741 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Kif3aP28741 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Kif3aP28741 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Kif3aP28741 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Kif3aP28741 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Kif3aP28741 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Kif3aP28741 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Kif3aP28741 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Kif3aP28741 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Kif3aP28741 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Kif3aP28741 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Kif3aP28741 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Kif3aP28741 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Kif3aP28741 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Kif3aP28741 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Kif3aP28741 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Kif3aP28741 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Kif3aP28741 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Kif3aP28741 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Kif3aP28741 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Kif3aP28741 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Kif3aP28741 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Kif3aP28741 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Kif3aP28741 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Kif3aP28741 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Kif3aP28741 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Kif3aP28741 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Kif3aP28741 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Kif3aP28741 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Kif3aP28741 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Kif3aP28741 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Kif3aP28741 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms