Protein–RNA interactions for Protein: P28076

Psmb9, Proteasome subunit beta type-9, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb9P28076 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Psmb9P28076 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Psmb9P28076 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Psmb9P28076 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Psmb9P28076 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Psmb9P28076 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Psmb9P28076 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Psmb9P28076 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Psmb9P28076 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Psmb9P28076 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Psmb9P28076 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Psmb9P28076 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Psmb9P28076 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Psmb9P28076 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Psmb9P28076 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Psmb9P28076 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Psmb9P28076 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Psmb9P28076 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Psmb9P28076 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Psmb9P28076 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Psmb9P28076 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Psmb9P28076 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Psmb9P28076 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Psmb9P28076 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Psmb9P28076 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Psmb9P28076 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Psmb9P28076 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Psmb9P28076 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Psmb9P28076 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Psmb9P28076 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Psmb9P28076 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Psmb9P28076 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Psmb9P28076 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Psmb9P28076 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Psmb9P28076 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Psmb9P28076 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Psmb9P28076 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Psmb9P28076 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Psmb9P28076 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Psmb9P28076 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Psmb9P28076 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Psmb9P28076 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Psmb9P28076 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Psmb9P28076 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Psmb9P28076 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Psmb9P28076 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Psmb9P28076 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Psmb9P28076 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Psmb9P28076 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Psmb9P28076 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Psmb9P28076 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Psmb9P28076 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Psmb9P28076 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Psmb9P28076 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Psmb9P28076 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Psmb9P28076 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Psmb9P28076 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Psmb9P28076 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Psmb9P28076 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Psmb9P28076 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Psmb9P28076 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Psmb9P28076 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Psmb9P28076 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Psmb9P28076 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Psmb9P28076 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Psmb9P28076 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Psmb9P28076 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Psmb9P28076 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Psmb9P28076 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Psmb9P28076 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Psmb9P28076 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Psmb9P28076 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Psmb9P28076 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Psmb9P28076 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Psmb9P28076 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Psmb9P28076 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Psmb9P28076 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Psmb9P28076 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Psmb9P28076 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Psmb9P28076 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Psmb9P28076 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Psmb9P28076 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Psmb9P28076 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Psmb9P28076 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Psmb9P28076 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Psmb9P28076 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Psmb9P28076 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Psmb9P28076 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Psmb9P28076 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Psmb9P28076 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Psmb9P28076 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Psmb9P28076 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Psmb9P28076 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Psmb9P28076 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Psmb9P28076 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Psmb9P28076 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Psmb9P28076 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Psmb9P28076 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Psmb9P28076 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Psmb9P28076 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.7 ms