Protein–RNA interactions for Protein: P24399

Znf239, Zinc finger protein 239, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf239P24399 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Znf239P24399 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Znf239P24399 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Znf239P24399 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Znf239P24399 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Znf239P24399 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Znf239P24399 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Znf239P24399 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Znf239P24399 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf239P24399 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf239P24399 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf239P24399 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf239P24399 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf239P24399 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf239P24399 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf239P24399 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf239P24399 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf239P24399 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf239P24399 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf239P24399 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf239P24399 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf239P24399 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf239P24399 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf239P24399 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Znf239P24399 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Znf239P24399 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Znf239P24399 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Znf239P24399 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Znf239P24399 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Znf239P24399 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Znf239P24399 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Znf239P24399 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Znf239P24399 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Znf239P24399 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Znf239P24399 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Znf239P24399 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Znf239P24399 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Znf239P24399 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Znf239P24399 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Znf239P24399 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Znf239P24399 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Znf239P24399 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Znf239P24399 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Znf239P24399 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Znf239P24399 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Znf239P24399 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Znf239P24399 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Znf239P24399 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Znf239P24399 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Znf239P24399 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Znf239P24399 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Znf239P24399 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Znf239P24399 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Znf239P24399 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Znf239P24399 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Znf239P24399 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Znf239P24399 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Znf239P24399 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Znf239P24399 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Znf239P24399 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Znf239P24399 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Znf239P24399 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Znf239P24399 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Znf239P24399 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Znf239P24399 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Znf239P24399 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Znf239P24399 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Znf239P24399 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Znf239P24399 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Znf239P24399 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Znf239P24399 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Znf239P24399 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Znf239P24399 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Znf239P24399 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Znf239P24399 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Znf239P24399 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Znf239P24399 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Znf239P24399 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Znf239P24399 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Znf239P24399 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Znf239P24399 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Znf239P24399 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Znf239P24399 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Znf239P24399 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Znf239P24399 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Znf239P24399 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Znf239P24399 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Znf239P24399 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Znf239P24399 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Znf239P24399 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Znf239P24399 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Znf239P24399 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Znf239P24399 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Znf239P24399 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Znf239P24399 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Znf239P24399 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Znf239P24399 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Znf239P24399 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Znf239P24399 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Znf239P24399 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms