Protein–RNA interactions for Protein: P19788

Mgp, Matrix Gla protein, mousemouse

Predictions only

Length 104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MgpP19788 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MgpP19788 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MgpP19788 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MgpP19788 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MgpP19788 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MgpP19788 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MgpP19788 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MgpP19788 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MgpP19788 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MgpP19788 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MgpP19788 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MgpP19788 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MgpP19788 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MgpP19788 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MgpP19788 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MgpP19788 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MgpP19788 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MgpP19788 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MgpP19788 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MgpP19788 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MgpP19788 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MgpP19788 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MgpP19788 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MgpP19788 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MgpP19788 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MgpP19788 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MgpP19788 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MgpP19788 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MgpP19788 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MgpP19788 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MgpP19788 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MgpP19788 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MgpP19788 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MgpP19788 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MgpP19788 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MgpP19788 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MgpP19788 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MgpP19788 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MgpP19788 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MgpP19788 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MgpP19788 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MgpP19788 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MgpP19788 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MgpP19788 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MgpP19788 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MgpP19788 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MgpP19788 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MgpP19788 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MgpP19788 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MgpP19788 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MgpP19788 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MgpP19788 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MgpP19788 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MgpP19788 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MgpP19788 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MgpP19788 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MgpP19788 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MgpP19788 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MgpP19788 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MgpP19788 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MgpP19788 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MgpP19788 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MgpP19788 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MgpP19788 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MgpP19788 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MgpP19788 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MgpP19788 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MgpP19788 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MgpP19788 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MgpP19788 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MgpP19788 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MgpP19788 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MgpP19788 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
MgpP19788 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MgpP19788 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MgpP19788 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MgpP19788 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MgpP19788 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
MgpP19788 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MgpP19788 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MgpP19788 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MgpP19788 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MgpP19788 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MgpP19788 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MgpP19788 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MgpP19788 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MgpP19788 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MgpP19788 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MgpP19788 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MgpP19788 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
MgpP19788 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MgpP19788 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MgpP19788 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MgpP19788 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MgpP19788 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MgpP19788 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MgpP19788 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MgpP19788 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MgpP19788 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MgpP19788 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms