Protein–RNA interactions for Protein: P17095

Hmga1, High mobility group protein HMG-I/HMG-Y, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmga1P17095 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Hmga1P17095 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hmga1P17095 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hmga1P17095 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hmga1P17095 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hmga1P17095 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hmga1P17095 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Hmga1P17095 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hmga1P17095 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hmga1P17095 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hmga1P17095 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hmga1P17095 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hmga1P17095 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hmga1P17095 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Hmga1P17095 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hmga1P17095 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hmga1P17095 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Hmga1P17095 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Hmga1P17095 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hmga1P17095 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hmga1P17095 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hmga1P17095 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hmga1P17095 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hmga1P17095 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Hmga1P17095 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hmga1P17095 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hmga1P17095 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Hmga1P17095 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hmga1P17095 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hmga1P17095 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hmga1P17095 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hmga1P17095 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hmga1P17095 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hmga1P17095 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hmga1P17095 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hmga1P17095 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hmga1P17095 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hmga1P17095 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Hmga1P17095 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Hmga1P17095 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hmga1P17095 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hmga1P17095 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hmga1P17095 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hmga1P17095 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hmga1P17095 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hmga1P17095 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hmga1P17095 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hmga1P17095 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hmga1P17095 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hmga1P17095 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hmga1P17095 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Hmga1P17095 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hmga1P17095 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hmga1P17095 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hmga1P17095 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hmga1P17095 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hmga1P17095 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hmga1P17095 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hmga1P17095 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hmga1P17095 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hmga1P17095 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hmga1P17095 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hmga1P17095 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Hmga1P17095 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hmga1P17095 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hmga1P17095 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hmga1P17095 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hmga1P17095 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hmga1P17095 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hmga1P17095 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hmga1P17095 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Hmga1P17095 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Hmga1P17095 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Hmga1P17095 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Hmga1P17095 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hmga1P17095 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hmga1P17095 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hmga1P17095 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hmga1P17095 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hmga1P17095 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hmga1P17095 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hmga1P17095 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hmga1P17095 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hmga1P17095 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hmga1P17095 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Hmga1P17095 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hmga1P17095 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hmga1P17095 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hmga1P17095 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hmga1P17095 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hmga1P17095 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hmga1P17095 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hmga1P17095 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hmga1P17095 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hmga1P17095 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hmga1P17095 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hmga1P17095 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Hmga1P17095 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hmga1P17095 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hmga1P17095 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms