Protein–RNA interactions for Protein: P09632

Hoxb8, Homeobox protein Hox-B8, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb8P09632 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hoxb8P09632 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hoxb8P09632 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hoxb8P09632 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hoxb8P09632 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hoxb8P09632 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hoxb8P09632 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hoxb8P09632 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hoxb8P09632 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hoxb8P09632 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hoxb8P09632 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hoxb8P09632 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hoxb8P09632 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hoxb8P09632 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hoxb8P09632 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hoxb8P09632 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hoxb8P09632 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hoxb8P09632 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hoxb8P09632 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hoxb8P09632 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hoxb8P09632 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hoxb8P09632 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hoxb8P09632 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hoxb8P09632 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hoxb8P09632 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hoxb8P09632 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hoxb8P09632 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hoxb8P09632 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hoxb8P09632 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hoxb8P09632 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hoxb8P09632 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hoxb8P09632 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Hoxb8P09632 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hoxb8P09632 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hoxb8P09632 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hoxb8P09632 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hoxb8P09632 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Hoxb8P09632 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hoxb8P09632 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hoxb8P09632 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hoxb8P09632 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Hoxb8P09632 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hoxb8P09632 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hoxb8P09632 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hoxb8P09632 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hoxb8P09632 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hoxb8P09632 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hoxb8P09632 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hoxb8P09632 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hoxb8P09632 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hoxb8P09632 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hoxb8P09632 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hoxb8P09632 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Hoxb8P09632 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Hoxb8P09632 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hoxb8P09632 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hoxb8P09632 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hoxb8P09632 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hoxb8P09632 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hoxb8P09632 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Hoxb8P09632 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hoxb8P09632 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hoxb8P09632 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hoxb8P09632 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hoxb8P09632 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hoxb8P09632 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hoxb8P09632 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hoxb8P09632 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hoxb8P09632 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hoxb8P09632 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Hoxb8P09632 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hoxb8P09632 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hoxb8P09632 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hoxb8P09632 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hoxb8P09632 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hoxb8P09632 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hoxb8P09632 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Hoxb8P09632 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Hoxb8P09632 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Hoxb8P09632 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hoxb8P09632 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hoxb8P09632 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hoxb8P09632 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hoxb8P09632 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hoxb8P09632 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hoxb8P09632 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hoxb8P09632 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hoxb8P09632 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hoxb8P09632 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Hoxb8P09632 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hoxb8P09632 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hoxb8P09632 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hoxb8P09632 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hoxb8P09632 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Hoxb8P09632 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hoxb8P09632 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hoxb8P09632 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hoxb8P09632 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hoxb8P09632 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hoxb8P09632 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms