Protein–RNA interactions for Protein: P01736

T-cell receptor beta chain V region PHDS203 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01736 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01736 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01736 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01736 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01736 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01736 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01736 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01736 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01736 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01736 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
P01736 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01736 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01736 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01736 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01736 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01736 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01736 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01736 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01736 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01736 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01736 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01736 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01736 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
P01736 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01736 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01736 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01736 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01736 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01736 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01736 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
P01736 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01736 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01736 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01736 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01736 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01736 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
P01736 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
P01736 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
P01736 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
P01736 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01736 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01736 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01736 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01736 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01736 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01736 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01736 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01736 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01736 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01736 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01736 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01736 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01736 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01736 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01736 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01736 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01736 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01736 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01736 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01736 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01736 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
P01736 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01736 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01736 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01736 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01736 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01736 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01736 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01736 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01736 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01736 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01736 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01736 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01736 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
P01736 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01736 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01736 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01736 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
P01736 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01736 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01736 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01736 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01736 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01736 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01736 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01736 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01736 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01736 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01736 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01736 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01736 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01736 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01736 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01736 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01736 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01736 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01736 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01736 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01736 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01736 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms