Protein–RNA interactions for Protein: O35445

Rnf5, E3 ubiquitin-protein ligase RNF5, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf5O35445 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnf5O35445 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnf5O35445 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnf5O35445 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnf5O35445 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnf5O35445 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnf5O35445 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnf5O35445 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnf5O35445 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf5O35445 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf5O35445 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf5O35445 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf5O35445 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf5O35445 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf5O35445 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf5O35445 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf5O35445 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf5O35445 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf5O35445 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf5O35445 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf5O35445 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf5O35445 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf5O35445 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf5O35445 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf5O35445 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf5O35445 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf5O35445 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf5O35445 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf5O35445 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf5O35445 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnf5O35445 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnf5O35445 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnf5O35445 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnf5O35445 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnf5O35445 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnf5O35445 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnf5O35445 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnf5O35445 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnf5O35445 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnf5O35445 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnf5O35445 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnf5O35445 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnf5O35445 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnf5O35445 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnf5O35445 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnf5O35445 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnf5O35445 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnf5O35445 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnf5O35445 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnf5O35445 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnf5O35445 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rnf5O35445 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rnf5O35445 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rnf5O35445 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rnf5O35445 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rnf5O35445 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rnf5O35445 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rnf5O35445 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rnf5O35445 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rnf5O35445 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rnf5O35445 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rnf5O35445 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnf5O35445 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnf5O35445 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnf5O35445 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnf5O35445 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnf5O35445 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnf5O35445 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnf5O35445 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnf5O35445 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnf5O35445 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnf5O35445 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnf5O35445 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnf5O35445 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnf5O35445 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnf5O35445 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnf5O35445 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnf5O35445 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnf5O35445 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnf5O35445 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnf5O35445 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf5O35445 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf5O35445 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf5O35445 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf5O35445 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf5O35445 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf5O35445 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf5O35445 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf5O35445 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf5O35445 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf5O35445 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf5O35445 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf5O35445 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf5O35445 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf5O35445 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf5O35445 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf5O35445 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf5O35445 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf5O35445 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf5O35445 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms