Protein–RNA interactions for Protein: O35424

H2-Ob, Histocompatibility 2, O region beta locus, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-ObO35424 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
H2-ObO35424 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
H2-ObO35424 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
H2-ObO35424 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
H2-ObO35424 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
H2-ObO35424 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
H2-ObO35424 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
H2-ObO35424 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
H2-ObO35424 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
H2-ObO35424 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
H2-ObO35424 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
H2-ObO35424 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
H2-ObO35424 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
H2-ObO35424 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
H2-ObO35424 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
H2-ObO35424 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
H2-ObO35424 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
H2-ObO35424 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
H2-ObO35424 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
H2-ObO35424 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
H2-ObO35424 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
H2-ObO35424 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
H2-ObO35424 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
H2-ObO35424 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
H2-ObO35424 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
H2-ObO35424 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
H2-ObO35424 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
H2-ObO35424 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
H2-ObO35424 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
H2-ObO35424 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
H2-ObO35424 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
H2-ObO35424 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
H2-ObO35424 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
H2-ObO35424 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
H2-ObO35424 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
H2-ObO35424 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
H2-ObO35424 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
H2-ObO35424 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
H2-ObO35424 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
H2-ObO35424 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
H2-ObO35424 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
H2-ObO35424 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
H2-ObO35424 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
H2-ObO35424 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
H2-ObO35424 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
H2-ObO35424 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
H2-ObO35424 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
H2-ObO35424 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
H2-ObO35424 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
H2-ObO35424 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
H2-ObO35424 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
H2-ObO35424 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
H2-ObO35424 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
H2-ObO35424 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
H2-ObO35424 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
H2-ObO35424 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
H2-ObO35424 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
H2-ObO35424 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
H2-ObO35424 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
H2-ObO35424 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
H2-ObO35424 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
H2-ObO35424 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
H2-ObO35424 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
H2-ObO35424 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
H2-ObO35424 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
H2-ObO35424 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
H2-ObO35424 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
H2-ObO35424 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
H2-ObO35424 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
H2-ObO35424 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
H2-ObO35424 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
H2-ObO35424 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
H2-ObO35424 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
H2-ObO35424 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
H2-ObO35424 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
H2-ObO35424 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
H2-ObO35424 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
H2-ObO35424 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
H2-ObO35424 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
H2-ObO35424 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
H2-ObO35424 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
H2-ObO35424 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
H2-ObO35424 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
H2-ObO35424 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
H2-ObO35424 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
H2-ObO35424 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
H2-ObO35424 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
H2-ObO35424 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
H2-ObO35424 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
H2-ObO35424 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
H2-ObO35424 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
H2-ObO35424 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
H2-ObO35424 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
H2-ObO35424 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
H2-ObO35424 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
H2-ObO35424 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
H2-ObO35424 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
H2-ObO35424 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
H2-ObO35424 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
H2-ObO35424 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms