Protein–RNA interactions for Protein: O08576

Rundc3a, RUN domain-containing protein 3A, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc3aO08576 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rundc3aO08576 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rundc3aO08576 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rundc3aO08576 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rundc3aO08576 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rundc3aO08576 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rundc3aO08576 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rundc3aO08576 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rundc3aO08576 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rundc3aO08576 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rundc3aO08576 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rundc3aO08576 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rundc3aO08576 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rundc3aO08576 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Rundc3aO08576 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rundc3aO08576 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rundc3aO08576 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rundc3aO08576 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rundc3aO08576 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rundc3aO08576 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Rundc3aO08576 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rundc3aO08576 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rundc3aO08576 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rundc3aO08576 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rundc3aO08576 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rundc3aO08576 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rundc3aO08576 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rundc3aO08576 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rundc3aO08576 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rundc3aO08576 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rundc3aO08576 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rundc3aO08576 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rundc3aO08576 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rundc3aO08576 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rundc3aO08576 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rundc3aO08576 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rundc3aO08576 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Rundc3aO08576 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rundc3aO08576 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rundc3aO08576 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rundc3aO08576 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rundc3aO08576 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rundc3aO08576 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rundc3aO08576 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rundc3aO08576 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rundc3aO08576 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rundc3aO08576 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rundc3aO08576 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rundc3aO08576 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rundc3aO08576 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rundc3aO08576 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rundc3aO08576 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rundc3aO08576 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rundc3aO08576 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rundc3aO08576 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Rundc3aO08576 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rundc3aO08576 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rundc3aO08576 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rundc3aO08576 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rundc3aO08576 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Rundc3aO08576 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rundc3aO08576 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rundc3aO08576 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rundc3aO08576 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rundc3aO08576 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rundc3aO08576 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rundc3aO08576 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Rundc3aO08576 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rundc3aO08576 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rundc3aO08576 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rundc3aO08576 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rundc3aO08576 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rundc3aO08576 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rundc3aO08576 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rundc3aO08576 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rundc3aO08576 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rundc3aO08576 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rundc3aO08576 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rundc3aO08576 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rundc3aO08576 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rundc3aO08576 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rundc3aO08576 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rundc3aO08576 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rundc3aO08576 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rundc3aO08576 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rundc3aO08576 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rundc3aO08576 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rundc3aO08576 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rundc3aO08576 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rundc3aO08576 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rundc3aO08576 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rundc3aO08576 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rundc3aO08576 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rundc3aO08576 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rundc3aO08576 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rundc3aO08576 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rundc3aO08576 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rundc3aO08576 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rundc3aO08576 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rundc3aO08576 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.2 ms