Protein–RNA interactions for Protein: J3QPD3

Gm8356, Predicted gene 8356, mousemouse

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8356J3QPD3 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm8356J3QPD3 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm8356J3QPD3 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm8356J3QPD3 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm8356J3QPD3 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm8356J3QPD3 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm8356J3QPD3 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm8356J3QPD3 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm8356J3QPD3 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm8356J3QPD3 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm8356J3QPD3 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm8356J3QPD3 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm8356J3QPD3 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm8356J3QPD3 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm8356J3QPD3 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm8356J3QPD3 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm8356J3QPD3 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm8356J3QPD3 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm8356J3QPD3 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm8356J3QPD3 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm8356J3QPD3 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm8356J3QPD3 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm8356J3QPD3 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm8356J3QPD3 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm8356J3QPD3 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm8356J3QPD3 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm8356J3QPD3 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm8356J3QPD3 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm8356J3QPD3 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm8356J3QPD3 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm8356J3QPD3 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm8356J3QPD3 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm8356J3QPD3 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm8356J3QPD3 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm8356J3QPD3 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm8356J3QPD3 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm8356J3QPD3 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm8356J3QPD3 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm8356J3QPD3 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm8356J3QPD3 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm8356J3QPD3 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm8356J3QPD3 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm8356J3QPD3 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm8356J3QPD3 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm8356J3QPD3 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm8356J3QPD3 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm8356J3QPD3 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm8356J3QPD3 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm8356J3QPD3 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm8356J3QPD3 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm8356J3QPD3 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm8356J3QPD3 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm8356J3QPD3 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm8356J3QPD3 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm8356J3QPD3 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm8356J3QPD3 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm8356J3QPD3 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm8356J3QPD3 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm8356J3QPD3 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm8356J3QPD3 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm8356J3QPD3 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm8356J3QPD3 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm8356J3QPD3 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm8356J3QPD3 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm8356J3QPD3 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm8356J3QPD3 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm8356J3QPD3 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm8356J3QPD3 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm8356J3QPD3 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm8356J3QPD3 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm8356J3QPD3 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm8356J3QPD3 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm8356J3QPD3 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm8356J3QPD3 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm8356J3QPD3 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm8356J3QPD3 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm8356J3QPD3 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm8356J3QPD3 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm8356J3QPD3 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm8356J3QPD3 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm8356J3QPD3 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm8356J3QPD3 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm8356J3QPD3 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm8356J3QPD3 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm8356J3QPD3 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm8356J3QPD3 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm8356J3QPD3 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm8356J3QPD3 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm8356J3QPD3 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm8356J3QPD3 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm8356J3QPD3 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm8356J3QPD3 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm8356J3QPD3 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm8356J3QPD3 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm8356J3QPD3 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm8356J3QPD3 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm8356J3QPD3 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm8356J3QPD3 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm8356J3QPD3 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm8356J3QPD3 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
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