Protein–RNA interactions for Protein: J3QPD3

Gm8356, Predicted gene 8356, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8356J3QPD3 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm8356J3QPD3 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm8356J3QPD3 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm8356J3QPD3 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm8356J3QPD3 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm8356J3QPD3 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm8356J3QPD3 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm8356J3QPD3 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm8356J3QPD3 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm8356J3QPD3 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm8356J3QPD3 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm8356J3QPD3 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm8356J3QPD3 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm8356J3QPD3 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm8356J3QPD3 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm8356J3QPD3 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm8356J3QPD3 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm8356J3QPD3 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm8356J3QPD3 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm8356J3QPD3 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm8356J3QPD3 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm8356J3QPD3 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm8356J3QPD3 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm8356J3QPD3 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm8356J3QPD3 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm8356J3QPD3 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm8356J3QPD3 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm8356J3QPD3 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm8356J3QPD3 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm8356J3QPD3 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm8356J3QPD3 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm8356J3QPD3 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm8356J3QPD3 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm8356J3QPD3 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm8356J3QPD3 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm8356J3QPD3 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm8356J3QPD3 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm8356J3QPD3 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm8356J3QPD3 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm8356J3QPD3 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm8356J3QPD3 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm8356J3QPD3 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm8356J3QPD3 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm8356J3QPD3 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm8356J3QPD3 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm8356J3QPD3 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm8356J3QPD3 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm8356J3QPD3 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm8356J3QPD3 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm8356J3QPD3 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm8356J3QPD3 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm8356J3QPD3 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm8356J3QPD3 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm8356J3QPD3 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm8356J3QPD3 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm8356J3QPD3 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm8356J3QPD3 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm8356J3QPD3 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm8356J3QPD3 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm8356J3QPD3 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm8356J3QPD3 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm8356J3QPD3 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm8356J3QPD3 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm8356J3QPD3 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm8356J3QPD3 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm8356J3QPD3 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm8356J3QPD3 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm8356J3QPD3 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm8356J3QPD3 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm8356J3QPD3 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm8356J3QPD3 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm8356J3QPD3 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm8356J3QPD3 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm8356J3QPD3 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm8356J3QPD3 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm8356J3QPD3 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm8356J3QPD3 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm8356J3QPD3 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm8356J3QPD3 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm8356J3QPD3 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm8356J3QPD3 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm8356J3QPD3 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm8356J3QPD3 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm8356J3QPD3 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm8356J3QPD3 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm8356J3QPD3 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm8356J3QPD3 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm8356J3QPD3 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm8356J3QPD3 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm8356J3QPD3 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm8356J3QPD3 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm8356J3QPD3 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm8356J3QPD3 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm8356J3QPD3 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm8356J3QPD3 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm8356J3QPD3 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm8356J3QPD3 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm8356J3QPD3 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm8356J3QPD3 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm8356J3QPD3 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms