Protein–RNA interactions for Protein: J3QP38

Gm21900, Predicted gene, 21900, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21900J3QP38 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm21900J3QP38 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm21900J3QP38 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm21900J3QP38 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm21900J3QP38 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm21900J3QP38 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm21900J3QP38 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm21900J3QP38 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm21900J3QP38 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm21900J3QP38 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm21900J3QP38 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm21900J3QP38 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm21900J3QP38 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm21900J3QP38 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm21900J3QP38 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm21900J3QP38 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm21900J3QP38 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm21900J3QP38 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm21900J3QP38 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm21900J3QP38 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm21900J3QP38 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm21900J3QP38 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm21900J3QP38 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm21900J3QP38 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm21900J3QP38 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm21900J3QP38 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm21900J3QP38 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm21900J3QP38 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm21900J3QP38 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm21900J3QP38 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gm21900J3QP38 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm21900J3QP38 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm21900J3QP38 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm21900J3QP38 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm21900J3QP38 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm21900J3QP38 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm21900J3QP38 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm21900J3QP38 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm21900J3QP38 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm21900J3QP38 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm21900J3QP38 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm21900J3QP38 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm21900J3QP38 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm21900J3QP38 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm21900J3QP38 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm21900J3QP38 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm21900J3QP38 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm21900J3QP38 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm21900J3QP38 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm21900J3QP38 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm21900J3QP38 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm21900J3QP38 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm21900J3QP38 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm21900J3QP38 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm21900J3QP38 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm21900J3QP38 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm21900J3QP38 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm21900J3QP38 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm21900J3QP38 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm21900J3QP38 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Gm21900J3QP38 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm21900J3QP38 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm21900J3QP38 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Gm21900J3QP38 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm21900J3QP38 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm21900J3QP38 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm21900J3QP38 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm21900J3QP38 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm21900J3QP38 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm21900J3QP38 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm21900J3QP38 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm21900J3QP38 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm21900J3QP38 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm21900J3QP38 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm21900J3QP38 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm21900J3QP38 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm21900J3QP38 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm21900J3QP38 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm21900J3QP38 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm21900J3QP38 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm21900J3QP38 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm21900J3QP38 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm21900J3QP38 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm21900J3QP38 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm21900J3QP38 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm21900J3QP38 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm21900J3QP38 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm21900J3QP38 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gm21900J3QP38 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gm21900J3QP38 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gm21900J3QP38 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm21900J3QP38 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm21900J3QP38 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm21900J3QP38 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm21900J3QP38 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm21900J3QP38 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm21900J3QP38 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm21900J3QP38 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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