Protein–RNA interactions for Protein: J3JS27

Vmn1r194, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r194J3JS27 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vmn1r194J3JS27 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vmn1r194J3JS27 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vmn1r194J3JS27 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vmn1r194J3JS27 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vmn1r194J3JS27 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vmn1r194J3JS27 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vmn1r194J3JS27 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vmn1r194J3JS27 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vmn1r194J3JS27 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vmn1r194J3JS27 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vmn1r194J3JS27 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vmn1r194J3JS27 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vmn1r194J3JS27 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vmn1r194J3JS27 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vmn1r194J3JS27 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vmn1r194J3JS27 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vmn1r194J3JS27 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vmn1r194J3JS27 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vmn1r194J3JS27 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vmn1r194J3JS27 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vmn1r194J3JS27 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vmn1r194J3JS27 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vmn1r194J3JS27 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Vmn1r194J3JS27 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Vmn1r194J3JS27 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Vmn1r194J3JS27 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vmn1r194J3JS27 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vmn1r194J3JS27 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vmn1r194J3JS27 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vmn1r194J3JS27 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vmn1r194J3JS27 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vmn1r194J3JS27 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vmn1r194J3JS27 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vmn1r194J3JS27 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vmn1r194J3JS27 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vmn1r194J3JS27 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vmn1r194J3JS27 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vmn1r194J3JS27 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vmn1r194J3JS27 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vmn1r194J3JS27 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vmn1r194J3JS27 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vmn1r194J3JS27 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vmn1r194J3JS27 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vmn1r194J3JS27 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vmn1r194J3JS27 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Vmn1r194J3JS27 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vmn1r194J3JS27 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vmn1r194J3JS27 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vmn1r194J3JS27 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Vmn1r194J3JS27 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vmn1r194J3JS27 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vmn1r194J3JS27 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vmn1r194J3JS27 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vmn1r194J3JS27 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vmn1r194J3JS27 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vmn1r194J3JS27 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vmn1r194J3JS27 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vmn1r194J3JS27 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vmn1r194J3JS27 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vmn1r194J3JS27 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vmn1r194J3JS27 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vmn1r194J3JS27 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vmn1r194J3JS27 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vmn1r194J3JS27 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vmn1r194J3JS27 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vmn1r194J3JS27 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vmn1r194J3JS27 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vmn1r194J3JS27 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn1r194J3JS27 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn1r194J3JS27 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn1r194J3JS27 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn1r194J3JS27 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn1r194J3JS27 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn1r194J3JS27 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn1r194J3JS27 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn1r194J3JS27 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn1r194J3JS27 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn1r194J3JS27 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn1r194J3JS27 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn1r194J3JS27 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn1r194J3JS27 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vmn1r194J3JS27 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vmn1r194J3JS27 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vmn1r194J3JS27 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vmn1r194J3JS27 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vmn1r194J3JS27 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vmn1r194J3JS27 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Vmn1r194J3JS27 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Vmn1r194J3JS27 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Vmn1r194J3JS27 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Vmn1r194J3JS27 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vmn1r194J3JS27 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vmn1r194J3JS27 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vmn1r194J3JS27 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vmn1r194J3JS27 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vmn1r194J3JS27 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vmn1r194J3JS27 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vmn1r194J3JS27 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vmn1r194J3JS27 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms