Protein–RNA interactions for Protein: G5E8C1

Vmn1r67, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r67G5E8C1 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn1r67G5E8C1 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn1r67G5E8C1 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn1r67G5E8C1 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn1r67G5E8C1 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn1r67G5E8C1 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn1r67G5E8C1 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn1r67G5E8C1 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn1r67G5E8C1 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn1r67G5E8C1 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn1r67G5E8C1 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn1r67G5E8C1 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn1r67G5E8C1 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Vmn1r67G5E8C1 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Vmn1r67G5E8C1 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Vmn1r67G5E8C1 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vmn1r67G5E8C1 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vmn1r67G5E8C1 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vmn1r67G5E8C1 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vmn1r67G5E8C1 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vmn1r67G5E8C1 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn1r67G5E8C1 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn1r67G5E8C1 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn1r67G5E8C1 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn1r67G5E8C1 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn1r67G5E8C1 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn1r67G5E8C1 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn1r67G5E8C1 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn1r67G5E8C1 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn1r67G5E8C1 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn1r67G5E8C1 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn1r67G5E8C1 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn1r67G5E8C1 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn1r67G5E8C1 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn1r67G5E8C1 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn1r67G5E8C1 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn1r67G5E8C1 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn1r67G5E8C1 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn1r67G5E8C1 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmn1r67G5E8C1 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmn1r67G5E8C1 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmn1r67G5E8C1 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmn1r67G5E8C1 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmn1r67G5E8C1 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmn1r67G5E8C1 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmn1r67G5E8C1 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmn1r67G5E8C1 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vmn1r67G5E8C1 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vmn1r67G5E8C1 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vmn1r67G5E8C1 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vmn1r67G5E8C1 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vmn1r67G5E8C1 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vmn1r67G5E8C1 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vmn1r67G5E8C1 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vmn1r67G5E8C1 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vmn1r67G5E8C1 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vmn1r67G5E8C1 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vmn1r67G5E8C1 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vmn1r67G5E8C1 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vmn1r67G5E8C1 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vmn1r67G5E8C1 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vmn1r67G5E8C1 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmn1r67G5E8C1 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmn1r67G5E8C1 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmn1r67G5E8C1 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmn1r67G5E8C1 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmn1r67G5E8C1 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmn1r67G5E8C1 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmn1r67G5E8C1 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmn1r67G5E8C1 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmn1r67G5E8C1 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vmn1r67G5E8C1 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vmn1r67G5E8C1 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vmn1r67G5E8C1 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vmn1r67G5E8C1 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vmn1r67G5E8C1 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vmn1r67G5E8C1 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vmn1r67G5E8C1 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vmn1r67G5E8C1 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Vmn1r67G5E8C1 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Vmn1r67G5E8C1 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vmn1r67G5E8C1 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vmn1r67G5E8C1 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vmn1r67G5E8C1 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Vmn1r67G5E8C1 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Vmn1r67G5E8C1 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Vmn1r67G5E8C1 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Vmn1r67G5E8C1 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn1r67G5E8C1 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn1r67G5E8C1 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn1r67G5E8C1 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn1r67G5E8C1 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn1r67G5E8C1 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn1r67G5E8C1 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn1r67G5E8C1 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn1r67G5E8C1 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn1r67G5E8C1 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn1r67G5E8C1 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn1r67G5E8C1 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn1r67G5E8C1 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms