Protein–RNA interactions for Protein: F6XS56

Gm8444, Predicted gene 8444, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8444F6XS56 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gm8444F6XS56 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gm8444F6XS56 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gm8444F6XS56 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm8444F6XS56 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm8444F6XS56 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm8444F6XS56 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm8444F6XS56 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm8444F6XS56 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm8444F6XS56 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm8444F6XS56 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm8444F6XS56 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm8444F6XS56 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm8444F6XS56 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm8444F6XS56 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm8444F6XS56 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm8444F6XS56 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm8444F6XS56 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm8444F6XS56 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm8444F6XS56 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm8444F6XS56 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm8444F6XS56 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm8444F6XS56 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm8444F6XS56 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm8444F6XS56 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm8444F6XS56 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm8444F6XS56 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm8444F6XS56 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm8444F6XS56 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm8444F6XS56 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm8444F6XS56 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm8444F6XS56 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm8444F6XS56 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm8444F6XS56 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm8444F6XS56 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm8444F6XS56 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm8444F6XS56 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm8444F6XS56 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm8444F6XS56 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm8444F6XS56 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm8444F6XS56 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm8444F6XS56 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm8444F6XS56 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm8444F6XS56 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm8444F6XS56 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm8444F6XS56 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm8444F6XS56 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm8444F6XS56 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm8444F6XS56 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm8444F6XS56 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm8444F6XS56 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm8444F6XS56 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm8444F6XS56 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm8444F6XS56 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm8444F6XS56 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm8444F6XS56 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm8444F6XS56 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Gm8444F6XS56 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Gm8444F6XS56 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Gm8444F6XS56 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm8444F6XS56 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm8444F6XS56 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm8444F6XS56 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm8444F6XS56 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm8444F6XS56 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm8444F6XS56 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm8444F6XS56 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm8444F6XS56 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm8444F6XS56 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm8444F6XS56 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm8444F6XS56 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm8444F6XS56 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm8444F6XS56 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm8444F6XS56 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm8444F6XS56 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm8444F6XS56 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm8444F6XS56 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm8444F6XS56 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm8444F6XS56 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm8444F6XS56 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm8444F6XS56 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm8444F6XS56 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm8444F6XS56 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm8444F6XS56 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm8444F6XS56 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm8444F6XS56 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm8444F6XS56 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm8444F6XS56 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm8444F6XS56 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm8444F6XS56 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm8444F6XS56 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm8444F6XS56 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm8444F6XS56 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm8444F6XS56 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm8444F6XS56 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm8444F6XS56 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm8444F6XS56 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm8444F6XS56 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm8444F6XS56 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm8444F6XS56 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms