Protein–RNA interactions for Protein: E9Q166

Atad2b, ATPase family, AAA domain-containing 2B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,460 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atad2bE9Q166 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
Atad2bE9Q166 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
Atad2bE9Q166 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
Atad2bE9Q166 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
Atad2bE9Q166 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC37.21■■■■□ 3.55
Atad2bE9Q166 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
Atad2bE9Q166 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC37.21■■■■□ 3.55
Atad2bE9Q166 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC37.2■■■■□ 3.55
Atad2bE9Q166 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC37.2■■■■□ 3.54
Atad2bE9Q166 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC37.2■■■■□ 3.54
Atad2bE9Q166 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.54
Atad2bE9Q166 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.54
Atad2bE9Q166 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC37.19■■■■□ 3.54
Atad2bE9Q166 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC37.19■■■■□ 3.54
Atad2bE9Q166 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC37.18■■■■□ 3.54
Atad2bE9Q166 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC37.18■■■■□ 3.54
Atad2bE9Q166 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC37.18■■■■□ 3.54
Atad2bE9Q166 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
Atad2bE9Q166 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
Atad2bE9Q166 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC37.17■■■■□ 3.54
Atad2bE9Q166 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC37.17■■■■□ 3.54
Atad2bE9Q166 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
Atad2bE9Q166 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC37.17■■■■□ 3.54
Atad2bE9Q166 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
Atad2bE9Q166 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
Atad2bE9Q166 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC37.15■■■■□ 3.54
Atad2bE9Q166 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
Atad2bE9Q166 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC37.15■■■■□ 3.54
Atad2bE9Q166 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
Atad2bE9Q166 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
Atad2bE9Q166 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
Atad2bE9Q166 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
Atad2bE9Q166 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.14■■■■□ 3.54
Atad2bE9Q166 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.54
Atad2bE9Q166 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC37.13■■■■□ 3.54
Atad2bE9Q166 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.13■■■■□ 3.54
Atad2bE9Q166 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC37.13■■■■□ 3.54
Atad2bE9Q166 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC37.13■■■■□ 3.54
Atad2bE9Q166 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
Atad2bE9Q166 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
Atad2bE9Q166 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
Atad2bE9Q166 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
Atad2bE9Q166 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC37.12■■■■□ 3.53
Atad2bE9Q166 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
Atad2bE9Q166 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
Atad2bE9Q166 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
Atad2bE9Q166 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC37.11■■■■□ 3.53
Atad2bE9Q166 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
Atad2bE9Q166 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
Atad2bE9Q166 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC37.1■■■■□ 3.53
Atad2bE9Q166 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
Atad2bE9Q166 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC37.1■■■■□ 3.53
Atad2bE9Q166 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC37.1■■■■□ 3.53
Atad2bE9Q166 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC37.09■■■■□ 3.53
Atad2bE9Q166 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
Atad2bE9Q166 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
Atad2bE9Q166 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC37.08■■■■□ 3.53
Atad2bE9Q166 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.53
Atad2bE9Q166 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC37.07■■■■□ 3.53
Atad2bE9Q166 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.53
Atad2bE9Q166 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
Atad2bE9Q166 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
Atad2bE9Q166 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.07■■■■□ 3.52
Atad2bE9Q166 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
Atad2bE9Q166 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
Atad2bE9Q166 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC37.06■■■■□ 3.52
Atad2bE9Q166 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
Atad2bE9Q166 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC37.04■■■■□ 3.52
Atad2bE9Q166 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC37.04■■■■□ 3.52
Atad2bE9Q166 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC37.04■■■■□ 3.52
Atad2bE9Q166 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC37.04■■■■□ 3.52
Atad2bE9Q166 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
Atad2bE9Q166 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
Atad2bE9Q166 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
Atad2bE9Q166 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
Atad2bE9Q166 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC37.03■■■■□ 3.52
Atad2bE9Q166 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
Atad2bE9Q166 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
Atad2bE9Q166 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
Atad2bE9Q166 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC37.02■■■■□ 3.52
Atad2bE9Q166 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
Atad2bE9Q166 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
Atad2bE9Q166 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.02■■■■□ 3.52
Atad2bE9Q166 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
Atad2bE9Q166 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
Atad2bE9Q166 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
Atad2bE9Q166 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC37.01■■■■□ 3.52
Atad2bE9Q166 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC37.01■■■■□ 3.51
Atad2bE9Q166 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
Atad2bE9Q166 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
Atad2bE9Q166 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
Atad2bE9Q166 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
Atad2bE9Q166 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC36.99■■■■□ 3.51
Atad2bE9Q166 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.99■■■■□ 3.51
Atad2bE9Q166 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC36.99■■■■□ 3.51
Atad2bE9Q166 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC36.99■■■■□ 3.51
Atad2bE9Q166 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
Atad2bE9Q166 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
Atad2bE9Q166 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC36.98■■■■□ 3.51
Atad2bE9Q166 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC36.98■■■■□ 3.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms