Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0V3

Vmn1r68, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r68E9Q0V3 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn1r68E9Q0V3 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Vmn1r68E9Q0V3 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Vmn1r68E9Q0V3 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vmn1r68E9Q0V3 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vmn1r68E9Q0V3 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vmn1r68E9Q0V3 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vmn1r68E9Q0V3 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn1r68E9Q0V3 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn1r68E9Q0V3 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn1r68E9Q0V3 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn1r68E9Q0V3 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn1r68E9Q0V3 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn1r68E9Q0V3 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn1r68E9Q0V3 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn1r68E9Q0V3 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn1r68E9Q0V3 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn1r68E9Q0V3 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn1r68E9Q0V3 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn1r68E9Q0V3 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn1r68E9Q0V3 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn1r68E9Q0V3 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn1r68E9Q0V3 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn1r68E9Q0V3 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn1r68E9Q0V3 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn1r68E9Q0V3 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn1r68E9Q0V3 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn1r68E9Q0V3 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn1r68E9Q0V3 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn1r68E9Q0V3 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmn1r68E9Q0V3 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmn1r68E9Q0V3 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmn1r68E9Q0V3 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmn1r68E9Q0V3 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmn1r68E9Q0V3 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmn1r68E9Q0V3 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmn1r68E9Q0V3 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vmn1r68E9Q0V3 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vmn1r68E9Q0V3 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vmn1r68E9Q0V3 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vmn1r68E9Q0V3 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vmn1r68E9Q0V3 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vmn1r68E9Q0V3 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vmn1r68E9Q0V3 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vmn1r68E9Q0V3 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vmn1r68E9Q0V3 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vmn1r68E9Q0V3 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vmn1r68E9Q0V3 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmn1r68E9Q0V3 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmn1r68E9Q0V3 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmn1r68E9Q0V3 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmn1r68E9Q0V3 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmn1r68E9Q0V3 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmn1r68E9Q0V3 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmn1r68E9Q0V3 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmn1r68E9Q0V3 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmn1r68E9Q0V3 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmn1r68E9Q0V3 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vmn1r68E9Q0V3 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vmn1r68E9Q0V3 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vmn1r68E9Q0V3 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vmn1r68E9Q0V3 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vmn1r68E9Q0V3 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vmn1r68E9Q0V3 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vmn1r68E9Q0V3 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vmn1r68E9Q0V3 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Vmn1r68E9Q0V3 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Vmn1r68E9Q0V3 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn1r68E9Q0V3 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn1r68E9Q0V3 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn1r68E9Q0V3 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn1r68E9Q0V3 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn1r68E9Q0V3 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn1r68E9Q0V3 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn1r68E9Q0V3 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn1r68E9Q0V3 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn1r68E9Q0V3 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn1r68E9Q0V3 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn1r68E9Q0V3 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn1r68E9Q0V3 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Vmn1r68E9Q0V3 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vmn1r68E9Q0V3 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vmn1r68E9Q0V3 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vmn1r68E9Q0V3 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vmn1r68E9Q0V3 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vmn1r68E9Q0V3 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vmn1r68E9Q0V3 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Vmn1r68E9Q0V3 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Vmn1r68E9Q0V3 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vmn1r68E9Q0V3 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn1r68E9Q0V3 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn1r68E9Q0V3 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn1r68E9Q0V3 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn1r68E9Q0V3 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn1r68E9Q0V3 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn1r68E9Q0V3 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn1r68E9Q0V3 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn1r68E9Q0V3 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn1r68E9Q0V3 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn1r68E9Q0V3 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms