Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2W7

Cyp3a59, Cytochrome P450, family 3, subfamily a, polypeptide 59, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp3a59D3Z2W7 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cyp3a59D3Z2W7 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cyp3a59D3Z2W7 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cyp3a59D3Z2W7 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Cyp3a59D3Z2W7 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cyp3a59D3Z2W7 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cyp3a59D3Z2W7 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cyp3a59D3Z2W7 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cyp3a59D3Z2W7 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cyp3a59D3Z2W7 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cyp3a59D3Z2W7 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cyp3a59D3Z2W7 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cyp3a59D3Z2W7 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cyp3a59D3Z2W7 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cyp3a59D3Z2W7 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cyp3a59D3Z2W7 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cyp3a59D3Z2W7 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cyp3a59D3Z2W7 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cyp3a59D3Z2W7 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cyp3a59D3Z2W7 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cyp3a59D3Z2W7 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cyp3a59D3Z2W7 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cyp3a59D3Z2W7 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cyp3a59D3Z2W7 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cyp3a59D3Z2W7 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cyp3a59D3Z2W7 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cyp3a59D3Z2W7 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cyp3a59D3Z2W7 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cyp3a59D3Z2W7 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cyp3a59D3Z2W7 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cyp3a59D3Z2W7 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Cyp3a59D3Z2W7 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cyp3a59D3Z2W7 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cyp3a59D3Z2W7 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cyp3a59D3Z2W7 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cyp3a59D3Z2W7 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cyp3a59D3Z2W7 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cyp3a59D3Z2W7 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cyp3a59D3Z2W7 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cyp3a59D3Z2W7 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cyp3a59D3Z2W7 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cyp3a59D3Z2W7 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cyp3a59D3Z2W7 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cyp3a59D3Z2W7 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cyp3a59D3Z2W7 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cyp3a59D3Z2W7 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cyp3a59D3Z2W7 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cyp3a59D3Z2W7 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cyp3a59D3Z2W7 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cyp3a59D3Z2W7 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cyp3a59D3Z2W7 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cyp3a59D3Z2W7 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cyp3a59D3Z2W7 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cyp3a59D3Z2W7 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cyp3a59D3Z2W7 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cyp3a59D3Z2W7 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cyp3a59D3Z2W7 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cyp3a59D3Z2W7 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cyp3a59D3Z2W7 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Cyp3a59D3Z2W7 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cyp3a59D3Z2W7 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cyp3a59D3Z2W7 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Cyp3a59D3Z2W7 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cyp3a59D3Z2W7 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cyp3a59D3Z2W7 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cyp3a59D3Z2W7 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cyp3a59D3Z2W7 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Cyp3a59D3Z2W7 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cyp3a59D3Z2W7 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cyp3a59D3Z2W7 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Cyp3a59D3Z2W7 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cyp3a59D3Z2W7 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cyp3a59D3Z2W7 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cyp3a59D3Z2W7 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cyp3a59D3Z2W7 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cyp3a59D3Z2W7 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cyp3a59D3Z2W7 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cyp3a59D3Z2W7 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cyp3a59D3Z2W7 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cyp3a59D3Z2W7 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cyp3a59D3Z2W7 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cyp3a59D3Z2W7 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cyp3a59D3Z2W7 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cyp3a59D3Z2W7 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cyp3a59D3Z2W7 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cyp3a59D3Z2W7 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cyp3a59D3Z2W7 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cyp3a59D3Z2W7 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cyp3a59D3Z2W7 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cyp3a59D3Z2W7 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cyp3a59D3Z2W7 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cyp3a59D3Z2W7 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cyp3a59D3Z2W7 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cyp3a59D3Z2W7 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cyp3a59D3Z2W7 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cyp3a59D3Z2W7 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cyp3a59D3Z2W7 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cyp3a59D3Z2W7 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cyp3a59D3Z2W7 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cyp3a59D3Z2W7 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms