Protein–RNA interactions for Protein: B2RUJ5

Apba1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 842 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apba1B2RUJ5 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Apba1B2RUJ5 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Apba1B2RUJ5 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Apba1B2RUJ5 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Apba1B2RUJ5 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Apba1B2RUJ5 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Apba1B2RUJ5 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Apba1B2RUJ5 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Apba1B2RUJ5 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Apba1B2RUJ5 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Apba1B2RUJ5 Gm43936-201ENSMUST00000203987 490 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Apba1B2RUJ5 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Apba1B2RUJ5 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Apba1B2RUJ5 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Apba1B2RUJ5 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Apba1B2RUJ5 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Apba1B2RUJ5 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Apba1B2RUJ5 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Apba1B2RUJ5 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Apba1B2RUJ5 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Apba1B2RUJ5 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Apba1B2RUJ5 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Apba1B2RUJ5 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Apba1B2RUJ5 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Apba1B2RUJ5 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Apba1B2RUJ5 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Apba1B2RUJ5 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Apba1B2RUJ5 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Apba1B2RUJ5 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Apba1B2RUJ5 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Apba1B2RUJ5 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Apba1B2RUJ5 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Apba1B2RUJ5 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Apba1B2RUJ5 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Apba1B2RUJ5 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Apba1B2RUJ5 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Apba1B2RUJ5 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Apba1B2RUJ5 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Apba1B2RUJ5 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Apba1B2RUJ5 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Apba1B2RUJ5 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Apba1B2RUJ5 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Apba1B2RUJ5 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Apba1B2RUJ5 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Apba1B2RUJ5 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Apba1B2RUJ5 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Apba1B2RUJ5 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Apba1B2RUJ5 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Apba1B2RUJ5 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Apba1B2RUJ5 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Apba1B2RUJ5 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Apba1B2RUJ5 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Apba1B2RUJ5 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Apba1B2RUJ5 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Apba1B2RUJ5 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Apba1B2RUJ5 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Apba1B2RUJ5 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Apba1B2RUJ5 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Apba1B2RUJ5 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Apba1B2RUJ5 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Apba1B2RUJ5 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Apba1B2RUJ5 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Apba1B2RUJ5 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Apba1B2RUJ5 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Apba1B2RUJ5 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Apba1B2RUJ5 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Apba1B2RUJ5 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Apba1B2RUJ5 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Apba1B2RUJ5 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Apba1B2RUJ5 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Apba1B2RUJ5 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Apba1B2RUJ5 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Apba1B2RUJ5 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Apba1B2RUJ5 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Apba1B2RUJ5 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Apba1B2RUJ5 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Apba1B2RUJ5 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Apba1B2RUJ5 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Apba1B2RUJ5 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Apba1B2RUJ5 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Apba1B2RUJ5 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Apba1B2RUJ5 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Apba1B2RUJ5 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Apba1B2RUJ5 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Apba1B2RUJ5 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Apba1B2RUJ5 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Apba1B2RUJ5 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Apba1B2RUJ5 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Apba1B2RUJ5 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Apba1B2RUJ5 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Apba1B2RUJ5 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Apba1B2RUJ5 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Apba1B2RUJ5 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Apba1B2RUJ5 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Apba1B2RUJ5 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Apba1B2RUJ5 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Apba1B2RUJ5 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Apba1B2RUJ5 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Apba1B2RUJ5 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Apba1B2RUJ5 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms