Protein–RNA interactions for Protein: B1AWZ3

Nipsnap3a, Nipsnap homolog 3A, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3aB1AWZ3 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nipsnap3aB1AWZ3 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nipsnap3aB1AWZ3 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nipsnap3aB1AWZ3 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Nipsnap3aB1AWZ3 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nipsnap3aB1AWZ3 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nipsnap3aB1AWZ3 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nipsnap3aB1AWZ3 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nipsnap3aB1AWZ3 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nipsnap3aB1AWZ3 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nipsnap3aB1AWZ3 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nipsnap3aB1AWZ3 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nipsnap3aB1AWZ3 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nipsnap3aB1AWZ3 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Nipsnap3aB1AWZ3 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nipsnap3aB1AWZ3 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nipsnap3aB1AWZ3 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nipsnap3aB1AWZ3 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Nipsnap3aB1AWZ3 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Nipsnap3aB1AWZ3 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Nipsnap3aB1AWZ3 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Nipsnap3aB1AWZ3 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nipsnap3aB1AWZ3 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nipsnap3aB1AWZ3 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nipsnap3aB1AWZ3 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nipsnap3aB1AWZ3 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nipsnap3aB1AWZ3 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nipsnap3aB1AWZ3 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nipsnap3aB1AWZ3 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nipsnap3aB1AWZ3 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nipsnap3aB1AWZ3 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nipsnap3aB1AWZ3 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nipsnap3aB1AWZ3 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nipsnap3aB1AWZ3 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nipsnap3aB1AWZ3 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nipsnap3aB1AWZ3 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nipsnap3aB1AWZ3 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Nipsnap3aB1AWZ3 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nipsnap3aB1AWZ3 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nipsnap3aB1AWZ3 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nipsnap3aB1AWZ3 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nipsnap3aB1AWZ3 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nipsnap3aB1AWZ3 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nipsnap3aB1AWZ3 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nipsnap3aB1AWZ3 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nipsnap3aB1AWZ3 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nipsnap3aB1AWZ3 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Nipsnap3aB1AWZ3 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nipsnap3aB1AWZ3 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nipsnap3aB1AWZ3 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nipsnap3aB1AWZ3 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nipsnap3aB1AWZ3 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nipsnap3aB1AWZ3 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nipsnap3aB1AWZ3 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nipsnap3aB1AWZ3 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nipsnap3aB1AWZ3 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nipsnap3aB1AWZ3 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nipsnap3aB1AWZ3 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nipsnap3aB1AWZ3 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nipsnap3aB1AWZ3 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nipsnap3aB1AWZ3 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nipsnap3aB1AWZ3 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nipsnap3aB1AWZ3 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Nipsnap3aB1AWZ3 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Nipsnap3aB1AWZ3 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Nipsnap3aB1AWZ3 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nipsnap3aB1AWZ3 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nipsnap3aB1AWZ3 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Nipsnap3aB1AWZ3 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nipsnap3aB1AWZ3 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nipsnap3aB1AWZ3 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nipsnap3aB1AWZ3 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nipsnap3aB1AWZ3 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Nipsnap3aB1AWZ3 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nipsnap3aB1AWZ3 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nipsnap3aB1AWZ3 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nipsnap3aB1AWZ3 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nipsnap3aB1AWZ3 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nipsnap3aB1AWZ3 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nipsnap3aB1AWZ3 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nipsnap3aB1AWZ3 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nipsnap3aB1AWZ3 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nipsnap3aB1AWZ3 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nipsnap3aB1AWZ3 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nipsnap3aB1AWZ3 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nipsnap3aB1AWZ3 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Nipsnap3aB1AWZ3 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Nipsnap3aB1AWZ3 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nipsnap3aB1AWZ3 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms