Protein–RNA interactions for Protein: A2APC3

Ttll9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll9A2APC3 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ttll9A2APC3 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ttll9A2APC3 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Ttll9A2APC3 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ttll9A2APC3 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ttll9A2APC3 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ttll9A2APC3 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ttll9A2APC3 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ttll9A2APC3 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ttll9A2APC3 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ttll9A2APC3 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ttll9A2APC3 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ttll9A2APC3 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ttll9A2APC3 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ttll9A2APC3 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ttll9A2APC3 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ttll9A2APC3 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ttll9A2APC3 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ttll9A2APC3 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ttll9A2APC3 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Ttll9A2APC3 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ttll9A2APC3 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ttll9A2APC3 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Ttll9A2APC3 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ttll9A2APC3 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ttll9A2APC3 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ttll9A2APC3 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ttll9A2APC3 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Ttll9A2APC3 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ttll9A2APC3 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ttll9A2APC3 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ttll9A2APC3 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ttll9A2APC3 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ttll9A2APC3 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ttll9A2APC3 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ttll9A2APC3 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ttll9A2APC3 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ttll9A2APC3 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ttll9A2APC3 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ttll9A2APC3 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ttll9A2APC3 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ttll9A2APC3 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ttll9A2APC3 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ttll9A2APC3 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ttll9A2APC3 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ttll9A2APC3 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ttll9A2APC3 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ttll9A2APC3 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ttll9A2APC3 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ttll9A2APC3 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ttll9A2APC3 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Ttll9A2APC3 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ttll9A2APC3 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ttll9A2APC3 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ttll9A2APC3 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ttll9A2APC3 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ttll9A2APC3 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ttll9A2APC3 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ttll9A2APC3 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Ttll9A2APC3 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ttll9A2APC3 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ttll9A2APC3 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ttll9A2APC3 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Ttll9A2APC3 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ttll9A2APC3 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ttll9A2APC3 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ttll9A2APC3 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ttll9A2APC3 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ttll9A2APC3 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ttll9A2APC3 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ttll9A2APC3 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ttll9A2APC3 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ttll9A2APC3 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ttll9A2APC3 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ttll9A2APC3 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ttll9A2APC3 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ttll9A2APC3 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ttll9A2APC3 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ttll9A2APC3 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ttll9A2APC3 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ttll9A2APC3 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ttll9A2APC3 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ttll9A2APC3 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ttll9A2APC3 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ttll9A2APC3 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ttll9A2APC3 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ttll9A2APC3 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ttll9A2APC3 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ttll9A2APC3 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ttll9A2APC3 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ttll9A2APC3 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ttll9A2APC3 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ttll9A2APC3 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ttll9A2APC3 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ttll9A2APC3 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ttll9A2APC3 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ttll9A2APC3 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ttll9A2APC3 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ttll9A2APC3 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ttll9A2APC3 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms