Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
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