Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WPV9

1700019A02Rik, RIKEN cDNA 1700019A02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700019A02RikA0A087WPV9 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
1700019A02RikA0A087WPV9 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
1700019A02RikA0A087WPV9 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
1700019A02RikA0A087WPV9 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
1700019A02RikA0A087WPV9 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
1700019A02RikA0A087WPV9 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
1700019A02RikA0A087WPV9 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
1700019A02RikA0A087WPV9 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
1700019A02RikA0A087WPV9 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
1700019A02RikA0A087WPV9 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
1700019A02RikA0A087WPV9 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
1700019A02RikA0A087WPV9 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
1700019A02RikA0A087WPV9 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
1700019A02RikA0A087WPV9 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
1700019A02RikA0A087WPV9 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
1700019A02RikA0A087WPV9 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
1700019A02RikA0A087WPV9 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
1700019A02RikA0A087WPV9 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
1700019A02RikA0A087WPV9 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
1700019A02RikA0A087WPV9 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
1700019A02RikA0A087WPV9 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
1700019A02RikA0A087WPV9 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
1700019A02RikA0A087WPV9 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
1700019A02RikA0A087WPV9 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
1700019A02RikA0A087WPV9 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
1700019A02RikA0A087WPV9 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
1700019A02RikA0A087WPV9 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
1700019A02RikA0A087WPV9 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
1700019A02RikA0A087WPV9 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
1700019A02RikA0A087WPV9 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
1700019A02RikA0A087WPV9 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
1700019A02RikA0A087WPV9 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
1700019A02RikA0A087WPV9 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
1700019A02RikA0A087WPV9 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
1700019A02RikA0A087WPV9 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
1700019A02RikA0A087WPV9 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
1700019A02RikA0A087WPV9 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
1700019A02RikA0A087WPV9 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
1700019A02RikA0A087WPV9 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
1700019A02RikA0A087WPV9 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
1700019A02RikA0A087WPV9 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
1700019A02RikA0A087WPV9 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
1700019A02RikA0A087WPV9 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
1700019A02RikA0A087WPV9 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
1700019A02RikA0A087WPV9 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
1700019A02RikA0A087WPV9 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
1700019A02RikA0A087WPV9 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
1700019A02RikA0A087WPV9 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
1700019A02RikA0A087WPV9 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
1700019A02RikA0A087WPV9 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
1700019A02RikA0A087WPV9 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
1700019A02RikA0A087WPV9 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
1700019A02RikA0A087WPV9 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
1700019A02RikA0A087WPV9 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
1700019A02RikA0A087WPV9 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
1700019A02RikA0A087WPV9 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
1700019A02RikA0A087WPV9 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
1700019A02RikA0A087WPV9 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
1700019A02RikA0A087WPV9 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
1700019A02RikA0A087WPV9 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
1700019A02RikA0A087WPV9 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
1700019A02RikA0A087WPV9 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
1700019A02RikA0A087WPV9 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
1700019A02RikA0A087WPV9 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
1700019A02RikA0A087WPV9 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
1700019A02RikA0A087WPV9 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
1700019A02RikA0A087WPV9 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
1700019A02RikA0A087WPV9 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
1700019A02RikA0A087WPV9 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
1700019A02RikA0A087WPV9 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
1700019A02RikA0A087WPV9 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
1700019A02RikA0A087WPV9 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
1700019A02RikA0A087WPV9 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
1700019A02RikA0A087WPV9 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
1700019A02RikA0A087WPV9 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
1700019A02RikA0A087WPV9 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
1700019A02RikA0A087WPV9 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
1700019A02RikA0A087WPV9 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
1700019A02RikA0A087WPV9 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
1700019A02RikA0A087WPV9 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
1700019A02RikA0A087WPV9 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
1700019A02RikA0A087WPV9 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
1700019A02RikA0A087WPV9 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
1700019A02RikA0A087WPV9 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
1700019A02RikA0A087WPV9 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
1700019A02RikA0A087WPV9 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
1700019A02RikA0A087WPV9 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
1700019A02RikA0A087WPV9 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
1700019A02RikA0A087WPV9 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
1700019A02RikA0A087WPV9 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
1700019A02RikA0A087WPV9 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 146.5 ms