Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0W3

Nup160, Nuclear pore complex protein Nup160, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup160Q9Z0W3 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Nup160Q9Z0W3 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Nup160Q9Z0W3 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Nup160Q9Z0W3 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Nup160Q9Z0W3 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
Nup160Q9Z0W3 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC33.82■■■■□ 3
Nup160Q9Z0W3 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC33.82■■■■□ 3
Nup160Q9Z0W3 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC33.82■■■■□ 3
Nup160Q9Z0W3 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC33.82■■■■□ 3
Nup160Q9Z0W3 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Nup160Q9Z0W3 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC33.82■■■■□ 3
Nup160Q9Z0W3 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC33.81■■■■□ 3
Nup160Q9Z0W3 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Nup160Q9Z0W3 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
Nup160Q9Z0W3 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC33.81■■■■□ 3
Nup160Q9Z0W3 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC33.81■■■■□ 3
Nup160Q9Z0W3 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC33.8■■■■□ 3
Nup160Q9Z0W3 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
Nup160Q9Z0W3 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Nup160Q9Z0W3 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Nup160Q9Z0W3 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Nup160Q9Z0W3 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC33.79■■■■□ 3
Nup160Q9Z0W3 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC33.79■■■■□ 3
Nup160Q9Z0W3 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Nup160Q9Z0W3 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Nup160Q9Z0W3 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC33.79■■■■□ 3
Nup160Q9Z0W3 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Nup160Q9Z0W3 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Nup160Q9Z0W3 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Nup160Q9Z0W3 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Nup160Q9Z0W3 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
Nup160Q9Z0W3 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
Nup160Q9Z0W3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Nup160Q9Z0W3 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Nup160Q9Z0W3 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC33.75■■■□□ 2.99
Nup160Q9Z0W3 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Nup160Q9Z0W3 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
Nup160Q9Z0W3 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Nup160Q9Z0W3 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Nup160Q9Z0W3 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Nup160Q9Z0W3 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
Nup160Q9Z0W3 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Nup160Q9Z0W3 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Nup160Q9Z0W3 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Nup160Q9Z0W3 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
Nup160Q9Z0W3 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Nup160Q9Z0W3 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Nup160Q9Z0W3 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
Nup160Q9Z0W3 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC33.71■■■□□ 2.99
Nup160Q9Z0W3 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Nup160Q9Z0W3 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Nup160Q9Z0W3 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
Nup160Q9Z0W3 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC33.7■■■□□ 2.99
Nup160Q9Z0W3 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Nup160Q9Z0W3 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Nup160Q9Z0W3 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
Nup160Q9Z0W3 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
Nup160Q9Z0W3 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
Nup160Q9Z0W3 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC33.69■■■□□ 2.98
Nup160Q9Z0W3 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Nup160Q9Z0W3 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC33.69■■■□□ 2.98
Nup160Q9Z0W3 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Nup160Q9Z0W3 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
Nup160Q9Z0W3 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
Nup160Q9Z0W3 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
Nup160Q9Z0W3 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
Nup160Q9Z0W3 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
Nup160Q9Z0W3 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Nup160Q9Z0W3 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
Nup160Q9Z0W3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Nup160Q9Z0W3 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Nup160Q9Z0W3 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Nup160Q9Z0W3 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
Nup160Q9Z0W3 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Nup160Q9Z0W3 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
Nup160Q9Z0W3 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Nup160Q9Z0W3 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Nup160Q9Z0W3 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC33.66■■■□□ 2.98
Nup160Q9Z0W3 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
Nup160Q9Z0W3 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Nup160Q9Z0W3 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
Nup160Q9Z0W3 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC33.65■■■□□ 2.98
Nup160Q9Z0W3 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
Nup160Q9Z0W3 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Nup160Q9Z0W3 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Nup160Q9Z0W3 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
Nup160Q9Z0W3 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
Nup160Q9Z0W3 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC33.63■■■□□ 2.97
Nup160Q9Z0W3 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Nup160Q9Z0W3 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
Nup160Q9Z0W3 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Nup160Q9Z0W3 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Nup160Q9Z0W3 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
Nup160Q9Z0W3 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Nup160Q9Z0W3 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
Nup160Q9Z0W3 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC33.62■■■□□ 2.97
Nup160Q9Z0W3 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Nup160Q9Z0W3 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
Nup160Q9Z0W3 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Nup160Q9Z0W3 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.8 ms