Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUL8

Cited4, Cbp/p300-interacting transactivator 4, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited4Q9WUL8 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cited4Q9WUL8 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cited4Q9WUL8 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cited4Q9WUL8 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cited4Q9WUL8 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cited4Q9WUL8 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cited4Q9WUL8 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cited4Q9WUL8 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cited4Q9WUL8 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cited4Q9WUL8 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cited4Q9WUL8 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cited4Q9WUL8 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cited4Q9WUL8 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Cited4Q9WUL8 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cited4Q9WUL8 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cited4Q9WUL8 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cited4Q9WUL8 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cited4Q9WUL8 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cited4Q9WUL8 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cited4Q9WUL8 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cited4Q9WUL8 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cited4Q9WUL8 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cited4Q9WUL8 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cited4Q9WUL8 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cited4Q9WUL8 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cited4Q9WUL8 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cited4Q9WUL8 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cited4Q9WUL8 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cited4Q9WUL8 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cited4Q9WUL8 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cited4Q9WUL8 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cited4Q9WUL8 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cited4Q9WUL8 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cited4Q9WUL8 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cited4Q9WUL8 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cited4Q9WUL8 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cited4Q9WUL8 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cited4Q9WUL8 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cited4Q9WUL8 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cited4Q9WUL8 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cited4Q9WUL8 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cited4Q9WUL8 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cited4Q9WUL8 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cited4Q9WUL8 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cited4Q9WUL8 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Cited4Q9WUL8 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cited4Q9WUL8 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cited4Q9WUL8 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cited4Q9WUL8 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cited4Q9WUL8 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cited4Q9WUL8 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cited4Q9WUL8 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cited4Q9WUL8 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cited4Q9WUL8 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cited4Q9WUL8 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cited4Q9WUL8 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cited4Q9WUL8 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cited4Q9WUL8 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cited4Q9WUL8 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cited4Q9WUL8 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cited4Q9WUL8 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cited4Q9WUL8 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cited4Q9WUL8 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cited4Q9WUL8 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cited4Q9WUL8 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cited4Q9WUL8 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cited4Q9WUL8 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cited4Q9WUL8 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cited4Q9WUL8 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cited4Q9WUL8 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cited4Q9WUL8 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cited4Q9WUL8 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cited4Q9WUL8 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cited4Q9WUL8 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cited4Q9WUL8 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cited4Q9WUL8 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cited4Q9WUL8 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cited4Q9WUL8 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cited4Q9WUL8 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cited4Q9WUL8 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cited4Q9WUL8 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cited4Q9WUL8 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cited4Q9WUL8 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cited4Q9WUL8 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cited4Q9WUL8 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cited4Q9WUL8 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cited4Q9WUL8 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cited4Q9WUL8 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cited4Q9WUL8 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cited4Q9WUL8 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cited4Q9WUL8 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cited4Q9WUL8 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cited4Q9WUL8 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cited4Q9WUL8 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cited4Q9WUL8 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cited4Q9WUL8 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cited4Q9WUL8 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cited4Q9WUL8 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Cited4Q9WUL8 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cited4Q9WUL8 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms