Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUD1

Stub1, STIP1 homology and U box-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stub1Q9WUD1 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Stub1Q9WUD1 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Stub1Q9WUD1 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Stub1Q9WUD1 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Stub1Q9WUD1 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Stub1Q9WUD1 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Stub1Q9WUD1 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Stub1Q9WUD1 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Stub1Q9WUD1 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Stub1Q9WUD1 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Stub1Q9WUD1 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Stub1Q9WUD1 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Stub1Q9WUD1 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Stub1Q9WUD1 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Stub1Q9WUD1 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Stub1Q9WUD1 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Stub1Q9WUD1 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Stub1Q9WUD1 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Stub1Q9WUD1 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Stub1Q9WUD1 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Stub1Q9WUD1 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Stub1Q9WUD1 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Stub1Q9WUD1 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Stub1Q9WUD1 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Stub1Q9WUD1 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Stub1Q9WUD1 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Stub1Q9WUD1 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Stub1Q9WUD1 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Stub1Q9WUD1 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Stub1Q9WUD1 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Stub1Q9WUD1 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Stub1Q9WUD1 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Stub1Q9WUD1 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Stub1Q9WUD1 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Stub1Q9WUD1 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Stub1Q9WUD1 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Stub1Q9WUD1 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Stub1Q9WUD1 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Stub1Q9WUD1 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Stub1Q9WUD1 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Stub1Q9WUD1 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Stub1Q9WUD1 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Stub1Q9WUD1 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Stub1Q9WUD1 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Stub1Q9WUD1 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Stub1Q9WUD1 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Stub1Q9WUD1 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Stub1Q9WUD1 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Stub1Q9WUD1 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Stub1Q9WUD1 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Stub1Q9WUD1 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Stub1Q9WUD1 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Stub1Q9WUD1 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Stub1Q9WUD1 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Stub1Q9WUD1 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Stub1Q9WUD1 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Stub1Q9WUD1 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Stub1Q9WUD1 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Stub1Q9WUD1 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Stub1Q9WUD1 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Stub1Q9WUD1 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Stub1Q9WUD1 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Stub1Q9WUD1 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Stub1Q9WUD1 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Stub1Q9WUD1 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Stub1Q9WUD1 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Stub1Q9WUD1 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Stub1Q9WUD1 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Stub1Q9WUD1 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Stub1Q9WUD1 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Stub1Q9WUD1 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Stub1Q9WUD1 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Stub1Q9WUD1 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Stub1Q9WUD1 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Stub1Q9WUD1 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Stub1Q9WUD1 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Stub1Q9WUD1 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Stub1Q9WUD1 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Stub1Q9WUD1 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Stub1Q9WUD1 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Stub1Q9WUD1 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Stub1Q9WUD1 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Stub1Q9WUD1 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Stub1Q9WUD1 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Stub1Q9WUD1 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Stub1Q9WUD1 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Stub1Q9WUD1 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Stub1Q9WUD1 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Stub1Q9WUD1 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Stub1Q9WUD1 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Stub1Q9WUD1 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Stub1Q9WUD1 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Stub1Q9WUD1 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Stub1Q9WUD1 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Stub1Q9WUD1 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Stub1Q9WUD1 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Stub1Q9WUD1 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Stub1Q9WUD1 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Stub1Q9WUD1 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Stub1Q9WUD1 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.9 ms